这是发展Biocet的版本;对于稳定版本,请参阅生物群。
生物导体版本:开发(3.16)
Biocet以三重素格格式显示不同的生物集。这三个tibbles是'元素,`set'和'elementset'。用户很容易激活这三个tibbles之一,以从DPLYR软件包中执行通用功能。映射功能和元素/集合的Web引用也可以在BioCet中获得。
作者:Kayla Morrell [AUT,CRE],Martin Morgan [AUT],Kevin Rue-Albrecht [CTB],LluísRevillaSancho [CTB]
维护者:kayla Morrell
引用(从r内,输入引用(“生物集”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ Biocet”(“ Biocet”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biocet”)
html | R脚本 | 生物集:代表整理中的元素集 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,基因表达,,,,kegg,,,,软件 |
版本 | 1.11.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.6),dplyr |
进口 | 方法,蒂布尔,utils,rlang,,,,plyr,,,,S4VECTORS,,,,Biocio,,,,AnnotationDbi,,,,keggrest,,,,Ontology Indexex,,,,花花公子 |
链接 | |
建议 | gseabase,,,,呼吸道,org.hs.eg.db,deseq2,,,,林玛,,,,Biocfilecache,go.db,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 雷根里奇 |
进口我 | CBEA,,,,麻雀 |
建议我 | dearseq |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | biocset_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | biocset_1.11.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Biocset_1.11.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocset |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/biocet |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biocset/ |
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