BiocParallel

DOI：10.18129 / b9.bioc.biocomparall.

这是发展BiocParallel版本;稳定的发布版本请参见BiocParallel。

用于平行评估的生物导体设施

生物导体版本:开发(3.13)

该包提供了用于并行评估的修改版本和新颖的功能实现，为Bioconductor对象量身定制。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Michel Lang [aut]， Ryan Thompson [aut]， Nitesh Turaga [aut]， Aaron Lun [ctb]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel')

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

BROWSEVIGNETTES（“BIOCPARILLELS”）

PDF	R脚本	1.生物共序介绍
PDF	R脚本	2.介绍BatchtoolsParam
PDF	R脚本	3.错误、日志和调试
PDF		参考手册
文本		消息

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.25.5
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	GPL-2 | GPL-3
取决于	方法
进口	属性,跑龙套,futile.logger平行,雪
链接	黑洞
建议	BiocGenerics， 工具，foreach,Batchjobs.,BBmisc,多达齐全,Rmpi,Genomicranges.,RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.,VariantAnnotation,Rsamtools,基因管理,ShortRead,codetools,RUnit,生物焦,knitr,Batchtools.,data.table
系统要求	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/bioconductor/biocomallal.
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/issues
取决于我	培根,BEclear,红衣主教,ClassifyR,clusterSeq,consensusSeekeR,文案,德科,德沃瑟,Dexseq.,DMCFB,DMCHMM,doppelgangR,DSS,盛宴,弗雷泽,GenomicFiles,hiReadsProcessor,检查,事,工商管理硕士,比赛,metagene2,ncGTW,Oscope,先驱者,PCAN,季节性ddna.,pRoloc,Rqc,测序,ShortRead,SigCheck,光谱,STROMA4,SummarizedBenchmark,股东价值分析,variancePartition,xcms
进口我	abseqR,ADImpute,粘贴,ALDEx2,AlphaBeta,阿尔卑斯山,AlpsNMR,amplican,亚瑟士,ASpediaFI,atSNP,bambu,强盗,基础知识,后面;,bayNorm,BiocNeighbors,BioCor,BiocSingular,BIOMM,Bionero.,BioNetStat,生物墨呢,biscuiteer,咆哮,布伦德布,BSSeq.,CAGEfightR,篮球选手,cellbaseR,蜂窝状,CelliD,cellmixs.,censcyt,chipexoqual.,chipqc.,ChromSCape,chromswitch,chromVAR,cnvranger.,CoGAPS,调味品,共识,contiBAIT,CoreGx,coseq,cpvSNP,CRISPRseek,CrispRVariants,csaw,Cydar.,CytoGLMM,cytomapper,dasper,dcGSA,debCAM,DEComplexDisease,derfinder,descan2.,DESeq2,DEsingle,DiffBind,dmrseq,剂量,DRIMSeq,DropletUtils,沙丘,easyRNASeq,emdomic.,erma.,ERSSA,逃避,exomePeak2,ExpHunterSuite,fgsea,FindMyFriends,flowcatchR,flowSpecs,GDCRNATools,GenoGAM,基因管理,genotypeeval,gmapR,gscreend,GSEABenchmarkeR,GSVA,GUIDEseq,h5vc,Hicbricks.,HiCcompare,HTSeqGenie,HTSFilter,IASVA.,icetea,理想的,ihwpaper.,ima,InPAS,兴趣,离子,首次公开募股,Isanalytics.,iva,KinSwingR,LineagePulse,Lisaclust.,loci2path,LowMACA,LRcell,MACPET,mbkmeans,麦克巴斯特,metabomxtr,metaseqR2,MethCP,METHYLAID.,甲基葡萄酒,methylInheritance,methylscaper,METNET.,米娅,miaViz,MIGSA,miloR,minfi,miQC,mixOmics,MMAPPR2,MOGAMUN,motifbreakR,MPRAnalyze,MsBackendMassbank.,MsBackendMGF.,msnbase.,msqrob2,MSstatsSampleSize,多种审核,mumosa,马斯喀特,NBAMSeq,NBSplice,NPARC,OmicsLonDA,orfik.,oveseg.,PAIRADISE,PCAtools,PDATK,PharmacoGx,pipeComp,婴儿车,PrecisionTrialDrawer,高伦雅芙,挑战,profileplyr,qpgraph,qsea,QuasR,RadioGx,Rcwl,重新计票,RegEnrich,重新,RJMCMCNucleosomes,RNAmodR,Rsamtools,Ruvcorr.,土星,撒尿,scClassify,scDblFinder,scDD,scde,SCFA.,散粒,骗子,斯通,司康饼,scoreInvHap,scPCA,食物,scRecover,颈背,scTHI,天窗,芝麻,SEtools,sigFeature,signatureSearch,singleCellTK,单,singscore,斯文,soGGi,SpectralTAD,Spicyr.,飞溅,拼接照片,srnadiff,Tapseq.,TarSeqQC,TBSignatureProfiler,ternarynet,TFBSTools,TMixClust,毒素,TPP2D,TRADESEQ.,tr,树ummariedexperiment.,特纳,时髦的,TSRchitect,TVTB,变型滤波器,Varianttools.,伶盗龙,waddR,Weitrix.,Zinbwave.
建议我	海滩日,CageWorkflow.,delayedarray,DIAlignR,glmgampoi.,HDF5Array,MethylAidData,netSmooth,omicsPrint,PureCN,randRotation,RcisTarget,重新预订,scGPS,SeqArray,systemPipeR,tenxbraindata.,TENxPBMCData,TFutils,TileDBArray,tofsims,TrajectoryUtils,TSCAN,uposencymotif
链接给我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocParallel_1.25.5.tar.gz
Windows二进制	BiocParallel_1.25.5.zip
Macos 10.13（高塞拉）	BiocParallel_1.25.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocParallel
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocParallel
包短网址	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocParallel/
包下载报告	下载数据