Bioconcotk

doi：10.18129/b9.bioc.bioconcotk

这是发展Bioconcotk的版本；对于稳定版本，请参阅Bioconcotk。

一般癌症基因组学的生物导体成分

生物导体版本：开发（3.16）

为癌症研究的基因组规模分析提供了各种工具的中心界面。

作者：文斯·凯里

维护者：vj Carey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ bioconcotk”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Bioconcotk”）

html	R脚本	Bioconcotk-生物导体的癌症成分
html	R脚本	策展码头概述
html	R脚本	将TCGA肿瘤代码映射到NCIT
PDF		参考手册

细节

生物浏览	库务，，，，CPGISLAND，，，，DNAMETHYLATY，，，，基因表达，，，，遗传因素，，，，免疫学，，，，SNP，，，，软件，，，，转录
版本	1.17.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.6.0），方法，utils
进口	复杂的图像，，，，S4VECTORS，，，，Bigrquery，，，，闪亮的，统计httr，，，，rjson，，，，dplyr，，，，马格里特， 网格，DT，，，，基因组机，，，，iranges，，，，GGPLOT2，，，，总结性特征，，，，DBI，，，，GenomicFeatures，，，，策展，，，，秤，，，，ggpubr，，，，plyr，，，，车，，，，图形，，，，rgraphviz
链接
建议	尼特，，，，dbplyr，，，，org.hs.eg.db，，，，多亚sayExexperiment，，，，生物使用，，，，Ontoproc，，，，本体学图，，，，pogos，，，，GenomeInfodB，，，，安息（> = 1.3.7），Biocfilecache，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，生物酶，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，RESHAPE2，，，，测试，，，，AnnotationDbi，，，，FDB.Infinium -Methylation.hg19，，，，ensdb.hsapiens.v75，，，，rmarkDown，，，，Rhdf5client
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Bioconcotk_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	bioconcotk_1.17.0.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Bioconcotk_1.17.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioconcotk
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/bioconcotk
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/bioconcotk/
软件包下载报告	下载统计