BiocGenerics

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocGenerics

这是发展BiocGenerics版本;稳定版请参见BiocGenerics．

在Bioconductor中使用的S4通用函数

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包定义了许多在Bioconductor中使用的S4通用函数。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BiocGenerics")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	0.43.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 4.0.0)，方法，utils，图形，统计
进口	方法，utils，图形，统计
链接
建议	Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，DelayedArray，Biostrings，Rsamtools，AnnotationDbi，affy，affyPLM，DESeq2，flowClust，MSnbase，注释，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocGenerics
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocGenerics/issues
全靠我	ACME，affy，affyPLM，altcdfenvs，amplican，AnnotationDbi，AnnotationForge，AnnotationHub，ATACseqQC，beadarray，bioassayR，Biobase，Biostrings，bnbc，BSgenome，bsseq，红衣主教，类别，categoryCompare，ChAMPdata，chipseq，ChIPseqR，ChromHeatMap，clusterExperiment，codelink，consensusDE，consensusSeekeR，copynumber，CoreGx，CRISPRseek，腰带，DelayedArray，ensembldb，ensemblVEP，ExperimentHub，ExperimentHubData，GDSArray，geneplotter，GenomeInfoDb，genomeIntervals，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicRanges，GenomicScores，ggbio，girafe，图，GSEABase，GUIDEseq，HelloRanges，interactiveDisplay，interactiveDisplayBase，IRanges，liftOver，工商管理硕士，MIGSA，MineICA，minfi，MLInterfaces，MotifDb，mpra，MSnbase，乘，NADfinder，ngsReports，益生元，OrganismDbi，pandaR，plethy，plyranges，PoTRA，profileplyr，PWMEnrich，QSutils，RareVariantVis，REDseq，Repitools，RnBeads，战，rsbml，S4Vectors，shinyMethyl，ShortRead，simplifyEnrichment，soGGi，spqn，StructuralVariantAnnotation，SummarizedBenchmark，svaNUMT，svaRetro，TEQC，tigre，topdownr，topGO，撤销，UniProt.ws，updateObject，VanillaICE，VariantAnnotation，VariantFiltering，VCFArray，XVector，山药
进口我	a4Preproc，affycoretools，affylmGUI，AllelicImbalance，AneuFinder，annmap，注释，AnnotationHubData，ArrayExpressHTS，ASpli，atena，AUCell，自治，bambu，bamsignals，基础知识，后面;，beachmat，bigmelon，biocGraph，BiocIO，BiocSingular，biotmle，biovizBase，biscuiteer，BiSeq，blima，breakpointR，BrowserViz，BSgenome，BubbleTree，bumphunter，BUSpaRse，CAGEfightR，篮球选手，卡斯珀，celaref，CellaRepertorium，CellBench，cellHTS2，CellMixS，CellTrails，cfDNAPro，cghMCR，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，别致的，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPpeakAnno，ChIPQC，ChIPseeker，chipseq，chromstaR，chromVAR，西塞罗，clusterSeq，cn.mops，cn，CNVPanelizer，CNVRanger，可可，可乐，compEpiTools，CompoundDb，contiBAIT，crisprBase，crisprBowtie，crisprBwa，crisprScore，crlmm，crossmeta，csaw，ctgGEM，腰带，curatedCRCData，curatedOvarianData，cydar，dada2，dagLogo，DAMEfinder，ddCt，decompTumor2Sig，deconvR，DEGreport，DelayedDataFrame，derfinder，DEScan2，DESeq2，命运，DEWSeq，DEXSeq，diffcoexp，diffHic，DirichletMultinomial，DiscoRhythm，DRIMSeq，DropletUtils，DrugVsDisease，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，eiR，eisaR，enhancerHomologSearch，enrichTF，epialleleR，epigenomix，epimutacions，epistack，EpiTxDb，epivizrChart，epivizrStandalone，erma，esATAC，exomePeak2，ExpHunterSuite，FamAgg，fastseg，ffpe，FindIT2，火焰，flowBin，flowClust，flowCore，flowFP，FlowSOM，flowSpecs，flowStats，flowWorkspace，fmcsR，弗雷泽，frma，GA4GHclient，GA4GHshiny，gcapc，genbankr，geneAttribution，geneClassifiers，genefilter，《创世纪》，GenomicAlignments，GenomicInteractions，GenomicTuples，genotypeeval，GenVisR，GeomxTools，GeoMxWorkflows，glmGamPoi，gmapR，gmoviz，goseq，哥特，gpuMagic，Gviz，HDF5Array，的热图，爱马仕，希尔达，hiReadsProcessor，hopach，HTSeqGenie，icetea，igvR，IHW，IHWpaper，ima，infercnv，检查，InTAD，intansv，InteractionSet，感兴趣，电离，iSEE，IsoformSwitchAnalyzeR，isomiRs，iva，KCsmart，KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO，KEGGdzPathwaysGEO，ldblock，LinTInd，lisaClust，萝拉，微波激射器，桅杆，事，餐，meshr，MetaboAnnotation，metaMS，metaseqR2，methInheritSim，MethylAid，methylPipe，methylumi，米娅，miaViz，microbiomeDataSets，microbiomeMarker，miloR，mimager，MinimumDistance，米拉，海市蜃楼，missMethyl，MMAPPR2，Modstrings，mogsa，蒙娜丽莎，单片眼镜，Motif2Site，motifbreakR，MouseGastrulationData，MouseThymusAgeing，msa，MSnID，MultiAssayExperiment，multicrispr，MultiDataSet，multiMiR，mumosa，MutationalPatterns，mzR，NanoStringNCTools，ncdfFlow，nearBynding，npGSEA，诊断，NxtIRFcore，奥得河，oligoClasses，OmicsLonDA，openCyto，openPrimeR，ORFik，先驱者，parglms，pcaMethods，PDATK，pdInfoBuilder，PharmacoGx，PhIPData，PhosR，phyloseq，π，钢琴，平，podkat，婴儿车，primirTSS，proDA，profileScoreDist，pRoloc，pRolocGUI，ProteoDisco，PSMatch，PureCN，pwOmics，QFeatures，qPLEXanalyzer，qsea，QuasR，R3CPET，R453Plus1Toolbox，RadioGx，RaggedExperiment，ramr，ramwas，美国广播公司，RcisTarget，RCy3，RCyjs，收回，REMP，ReportingTools，RGMQL，RGSEA，RiboCrypt，RiboDiPA，RiboProfiling，ribosomeProfilingQC，林格，RJMCMCNucleosomes，rnaEditr，RNAmodR，RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq，咆哮，的方式，Rqc，rqubic，Rsamtools，rsbml，rScudo，RTCGAToolbox，rtracklayer，SC3，SCArray，嘘，scDblFinder，scmap，SCnorm，范围，scPipe，食物，scRNAseq，颈背，天窗，SeqVarTools，sevenC，SGSeq，SharedObject，signatureSearch，签名者，单，SingleCellExperiment，SingleCellMultiModal，SingleMoleculeFootprinting，sitadela，SNPhood，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38，snpStats，麻雀，SpatialExperiment，spatialLIBD，spatzie，光谱，spicyR，飞溅，SplicingGraphs，SQLDataFrame，sRACIPE，sscu，斯坦，standR，strandCheckR，彩带，Structstrings，SummarizedExperiment，SynMut，systemPipeR，systemPipeRdata，TAPseq，目标，TarSeqQC，TBSignatureProfiler，TCGAutils，TCseq，TENxBUSData，TFBSTools，TitanCNA，ToxicoGx，trackViewer，transcriptR，石棉水泥板，TransView，TreeSummarizedExperiment，tRNA，tRNAdbImport，tRNAscanImport，TVTB，txcutr，Ularcirc，UMI4Cats，unifiedWMWqPCR，universalmotif，的作用，VariantTools，VariantToolsData，伶盗龙，wavClusteR，weitrix，xcms，XDE，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，XVector
建议我	acde，aggregateBioVar，目标，资产，ASURAT，BaalChIP，baySeq，BDMMAcorrect，bigmelon，bigPint，BiocCheck，BiocParallel，BiocStyle，biocViews，BioMM，biosigner，BiRewire，BLMA，BloodGen3Module，bnem，北欧化工，BUScorrect，BUSseq，咖啡馆，相机，CancerSubtypes，CausalR，ccrepe，cellmigRation，CellNOptR，CexoR，ChIPanalyser，ChIPXpress，CHRONOS，CINdex，cleanUpdTSeq，限幅器，clustComp，CNORfeeder，CNORfuzzy，coexnet，彗星，ConnectivityMap，共识，cosmiq，COSNet，cpvSNP，CytoTree，DAPAR，DEsubs，DExMA，DMRcaller，DMRcate，ENCODExplorerData，EnhancedVolcano，ENmix，epiNEM，EventPointer，fCCAC，fcScan，fgga，FGNet，FieldEffectCrc，flowCL，flowCut，flowTime，核磁共振，GateFinder，gCrisprTools，gdsfmt，宝石，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，geneplast.data，geneRxCluster，geNetClassifier，genomation，GEOquery，GMRP，GOstats，GraphPAC，GreyListChIP，grndata，GSVA，GWASTools，h5vc，哈曼，HarmanData，healthyControlsPresenceChecker，hiAnnotator，HiCDCPlus，hierGWAS，HIREewas，HPiP，超图，iCARE，iClusterPlus，illuminaio，immunotation，InPAS，INPower，首次公开募股，烤肉串，KEGGREST，花边，MAGAR，mAPKL，massiR，MatrixQCvis，MatrixRider，mbt，mCSEA，Mergeomics，金属底座，MetaboSignal，metagene，metagene2，metagenomeSeq，MetCirc，methylCC，methylInheritance，MetNet，微生物组，microRNAome，MIGSAdata，miRBaseConverter，miRcomp，mirIntegrator，miRLAB，mnem，mosbi，motifStack，multiClust，MultiMed，multiOmicsViz，MungeSumstats，MWASTools，NBSplice，ncRNAtools，nempi，netbiov，NetSAM，nondetects，NoRCE，nucleoSim，OMICsPCA，OncoScore，PAA，panelcn.mops，Path2PPI，PathNet，pathview，PCAtools，pepXMLTab，PhenStat，powerTCR，proBAMr，proFIA，pwrEWAS，pwrEWAS.data，qpgraph，quantro，QuartPAC，RBGL，rBiopaxParser，Rcade，rcellminer，rCGH，Rcpi，REBET，RegParallel，rfaRm，RGraph2js，Rgraphviz，rgsepd，riboSeqR，ROntoTools，ropls，ROSeq，研制，RTNduals，RTNsurvival，rTRM，SAIGEgds，sangerseqR，圣诞老人，衬衣，scDataviz，scmeth，用水晶球占卜，segmentSeq，SeqArray，seqPattern，seqTools，sesameData，SICtools，sigFeature，sigsquared，SIMAT，similaRpeak，SIMLR，singleCellTK，单，弹弓，SNPRelate，寄居，SpacePAC，sparseDOSSA，SparseSignatures，spatialHeatmap，specL，STATegRa，STRINGdb，追求者，systemPipeTools，移行细胞癌，TFEA。芯片，锡，transcriptogramer，TraRe，tra利用，TreeAndLeaf，trena，tripr，TRONCO，Uniquorn，variancePartition，左页，xcore，xcoredata
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocGenerics_0.43.0.tar.gz
Windows二进制	BiocGenerics_0.43.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocGenerics_0.43.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocGenerics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocGenerics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocGenerics/
软件包下载报告	下载数据