BiocFileCache

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocFileCache

这是发展BiocFileCache版本;稳定版请参见BiocFileCache．

跨会话管理文件

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包创建一个持久的磁盘文件缓存，用户可以添加、更新和检索这些文件。它对于管理昂贵或难以创建的资源(如自定义Txdb对象)、web资源和跨会话使用的数据文件非常有用。

作者:Lori Shepherd [aut, cre]， Martin Morgan [aut]

维护者:Lori Shepherd < Lori。Shepherd在roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BiocFileCache")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocFileCache”)

超文本标记语言	R脚本	BiocFileCache:跨会话管理文件资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，软件
版本	2.5.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，dbplyr(> = 1.0.0)
进口	方法，统计，效用，dplyr，RSQLite，DBI，rappdirs，filelock，旋度，httr
链接
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues
全靠我	AnnotationHub，ExperimentHub，JASPAR2022，RcwlPipelines，scATAC。资源管理器，TMExplorer
进口我	意大利苦杏酒，atSNP，自治，BayesSpace，BiocPkgTools，biodb，biomaRt，BioPlex，BrainSABER，brendaDb，bugsigdbr，cbaf，cBioPortalData，CellBench，conclus，CTDquerier，customCMPdb，dasper，drugTargetInteractions，easyRNASeq，enhancerHomologSearch，EnMCB，EnrichmentBrowser，EpiTxDb，fgga，GAPGOM，GenomicScores，GenomicSuperSignature，GRaNIE，GSEABenchmarkeR，gwascat，杂环胺，MBQN，netDx，NxtIRFcore，NxtIRFdata，奥得河，ontoProc，org.Mxanthus.db，Organism.dplyr，PANTHER.db，PhIPData，psichomics，recount3，recountmethylation，regutools，RiboDiPA，rpx，芝麻，签名者，SingleCellMultiModal，SingscoreAMLMutations，SpatialExperiment，spatialHeatmap，spatialLIBD，terraTCGAdata，TFutils，tomoseqr，tximeta，UMI4Cats，uncoverappLib，UniProt.ws，waddR
建议我	AnnotationForge，bambu，BiocOncoTK，BiocSet，chipseqDB，emtdata，EpiCompare，fastreeR，火焰，fluentGenomics，HiCDCPlus，HighlyReplicatedRNASeq，HumanTranscriptomeCompendium，MethReg，MethylSeqData，msigdb，Nebulosa，后代，qsvaR，scRNAseq，seqsetvis，simpleSingleCell，structToolbox，TCGAutils，TENxBrainData，TENxPBMCData，TimeSeriesExperiment，TREG，zellkonverter
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocFileCache_2.5.0.tar.gz
Windows二进制	BiocFileCache_2.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocFileCache_2.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocFileCache
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocFileCache/
软件包下载报告	下载数据