这是发展Biocor的版本;对于稳定版本,请参阅生物剂。
生物导体版本:开发(3.16)
根据KEGG和Reactome或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以针对途径或基因集,基因或簇计算,并与其他相似性相结合。它们可用于改善网络,基因选择,测试关系...
作者:LluísRevillaSancho [AUT,CRE],pau sancho-bru [ths],胡安·何塞·萨尔瓦特拉·洛扎诺[THS]
维护者:lluísRevillasancho
引用(从r内,输入引用(“生物量”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ biococor”(“ biocor”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biocor”)
html | R脚本 | 关于生物剂 |
html | R脚本 | 生物器的高级用法 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 聚类,,,,基因表达,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件,,,,统计信息,,,,系统生物学 |
版本 | 1.21.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | 生物比较,,,,gseabase,,,,矩阵, 方法 |
链接 | |
建议 | 呼吸道,,,,生物使用,,,,引导,,,,deseq2,,,,Gosemsim,,,,HMISC,,,,尼特(> = 1.35),org.hs.eg.db,,,,Reactome.db,,,,rmarkDown,,,,拼写,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,测试,,,,WGCNA |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biocorhttps://llrs.github.io/biocor/ |
BugReports | https://github.com/llrs/biocor/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Biocor_1.21.1.tar.gz |
Windows二进制 | Biocor_1.21.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Biocor_1.21.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocor |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物仪 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biocor/ |
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