生物剂

doi:10.18129/b9.bioc.biocor

这是发展Biocor的版本;对于稳定版本,请参阅生物剂

功能相似性

生物导体版本:开发(3.16)

根据KEGG和Reactome或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以针对途径或基因集,基因或簇计算,并与其他相似性相结合。它们可用于改善网络,基因选择,测试关系...

作者:LluísRevillaSancho [AUT,CRE],pau sancho-bru [ths],胡安·何塞·萨尔瓦特拉·洛扎诺[THS]

维护者:lluísRevillasancho

引用(从r内,输入引用(“生物量”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ biococor”(“ biocor”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biocor”)

html R脚本 关于生物剂
html R脚本 生物器的高级用法
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 聚类,,,,基因表达,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件,,,,统计信息,,,,系统生物学
版本 1.21.1
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.4.0)
进口 生物比较,,,,gseabase,,,,矩阵, 方法
链接
建议 呼吸道,,,,生物使用,,,,引导,,,,deseq2,,,,Gosemsim,,,,HMISC,,,,尼特(> = 1.35),org.hs.eg.db,,,,Reactome.db,,,,rmarkDown,,,,拼写,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,测试,,,,WGCNA
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biocorhttps://llrs.github.io/biocor/
BugReports https://github.com/llrs/biocor/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Biocor_1.21.1.tar.gz
Windows二进制 Biocor_1.21.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) Biocor_1.21.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocor
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物仪
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biocor/
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