- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- BasicSTARRseq(开发版)
BasicSTARRseq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.BasicSTARRseq
这是发展BasicSTARRseq版本;稳定的发布版本,请参阅BasicSTARRseq。
基本呼吁STARR-seq峰值数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
基本呼吁STARR-seq峰值数据基于方法中引入“全基因组定量增强活动地图被STARR-seq”阿诺et al。科学。2013年3月1日;339 (6123):1074 - 7。doi: 10.1126 /科学。1232542。Epub 2013年1月17日。
作者:安妮卡方式
维护人员:安妮卡方式<安妮卡。方式在ukmuenster.de >
从内部引用(R,回车引用(“BasicSTARRseq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BasicSTARRseq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BasicSTARRseq”)
| R脚本 | BasicSTARRseq.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 报道,FunctionalGenomics,FunctionalPrediction,GeneRegulation,PeakDetection,软件 |
| 版本 | 1.27.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | LGPL-3 |
| 取决于 | GenomicRanges,GenomicAlignments |
| 进口 | S4Vectors、方法、IRanges,GenomeInfoDb,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BasicSTARRseq_1.27.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BasicSTARRseq_1.27.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | BasicSTARRseq_1.27.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | BasicSTARRseq_1.27.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BasicSTARRseq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BasicSTARRseq |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BasicSTARRseq/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BasicSTARRseq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
