BasicSTARRseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.BasicSTARRseq

这是发展BasicSTARRseq版本;稳定的发布版本,请参阅BasicSTARRseq

基本呼吁STARR-seq峰值数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

基本呼吁STARR-seq峰值数据基于方法中引入“全基因组定量增强活动地图被STARR-seq”阿诺et al。科学。2013年3月1日;339 (6123):1074 - 7。doi: 10.1126 /科学。1232542。Epub 2013年1月17日。

作者:安妮卡方式

维护人员:安妮卡方式<安妮卡。方式在ukmuenster.de >

从内部引用(R,回车引用(“BasicSTARRseq”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BasicSTARRseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BasicSTARRseq”)

PDF R脚本 BasicSTARRseq.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 报道,FunctionalGenomics,FunctionalPrediction,GeneRegulation,PeakDetection,软件
版本 1.27.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 GenomicRanges,GenomicAlignments
进口 S4Vectors、方法、IRanges,GenomeInfoDb,统计数据
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 BasicSTARRseq_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 BasicSTARRseq_1.27.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) BasicSTARRseq_1.27.0.tgz
macOS二进制(arm64) BasicSTARRseq_1.27.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BasicSTARRseq
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BasicSTARRseq
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BasicSTARRseq/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BasicSTARRseq/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网