BaseSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.BaseSpaceR

这是发展BaseSpaceR的版本;稳定版请参见BaseSpaceR．

R SDK for BaseSpace RESTful API

Bioconductor版本:开发(3.17)

丰富的R接口到Illumina的BaseSpace云计算环境，支持快速开发数据分析和可视化工具。

作者:Adrian Alexa

维护者:Jared O'Connell

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BaseSpaceR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BaseSpaceR”)

PDF	R脚本	BaseSpaceR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ConnectTools，DataImport，DataRepresentation，遗传学，HighThroughputSequencing，基础设施，测序，软件
版本	1.43.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(10年)
许可证	Apache License 2.0
取决于	R (>= 2.15.0)，RCurl，RJSONIO
进口	方法
链接
建议	RUnit，IRanges，Rsamtools
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BaseSpaceR_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	BaseSpaceR_1.43.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BaseSpaceR_1.43.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BaseSpaceR_1.43.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BaseSpaceR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BaseSpaceR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BaseSpaceR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BaseSpaceR/
软件包下载报告	下载数据