BPRMeth

DOI:10.18129 / B9.bioc.BPRMeth

这是发展BPRMeth版本;稳定版请参见BPRMeth．

建模高阶甲基化剖面

Bioconductor版本:开发(3.17)

BPRMeth包是一种量化甲基化谱显式特征的概率方法，在某种程度上可以更容易地在下游建模工作中正式使用这些谱，例如预测基因表达水平或根据甲基化谱聚类基因组区域或细胞。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [aut, cre]

维护者:Chantriolnt-Andreas Kapourani

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BPRMeth")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BPRMeth”)

超文本标记语言	R脚本	BPRMeth:模拟高阶甲基化剖面
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FeatureExtraction，GeneExpression，GeneRegulation，遗传学，ImmunoOncology，KEGG，RNASeq，回归，测序，SingleCell，软件
版本	1.25.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)，GenomicRanges
进口	为了、方法、质量，doParallel平行,e1071，地球，foreach，randomForest统计数据,IRanges，S4Vectors，data.table、图形、truncnorm，mvtnorm，Rcpp(> = 0.12.14),matrixcalc，magrittr，kernlab，ggplot2，cowplot，BiocStyle
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	testthat，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	梅丽莎
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BPRMeth_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	BPRMeth_1.25.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BPRMeth_1.25.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BPRMeth_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BPRMeth
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BPRMeth/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/
软件包下载报告	下载数据