这是发展注释过滤器的版本;稳定版请参见AnnotationFilter.
Bioconductor版本:开发(3.17)
这个包提供类和其他基础设施来实现用于操作Bioconductor注释资源的过滤器。滤光片将被整体使用,有机体。Dplyr和其他软件包。
作者:Martin Morgan [aut], Johannes Rainer [aut], Joachim Bargsten [ctb], Daniel Van Twisk [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“AnnotationFilter”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("AnnotationFilter")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AnnotationFilter”)
超文本标记语言 | R脚本 | 过滤生物导体注释资源的设施 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.23.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4.0) |
进口 | 跑龙套、方法GenomicRanges,lazyeval |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,testthat,RSQLite,org.Hs.eg.db,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Bioconductor/AnnotationFilter |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/AnnotationFilter/issues |
全靠我 | chimeraviz,CompoundDb,ensembldb,Organism.dplyr |
进口我 | biovizBase,BUSpaRse,drugTargetInteractions,GenomicDistributionsData,ggbio,proteasy,QFeatures,日坛,scanMiRApp,TVTB |
建议我 | dasper,GenomicDistributions,GenomicFeatures,TFutils,wiggleplotr |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | AnnotationFilter_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationFilter_1.23.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | AnnotationFilter_1.23.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | AnnotationFilter_1.23.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationFilter |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AnnotationFilter |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/AnnotationFilter/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationFilter/ |
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