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AlphaBeta
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DOI:10.18129 / B9.bioc.AlphaBeta
这是发展AlphaBeta版本;稳定的发布版本请参见AlphaBeta。
植物高通量DNA甲基化数据推断推断率和谱
生物导体版本:开发(3.14)
AlphaBeta是一种计算方法，从植物高通量DNA甲基化数据中估计推测率和光谱。该方法被专门设计用于:1。在多代突变积累系(MA-lines)的背景下分析“种系”的推断。2.在植物发育和衰老的背景下分析“体细胞”推断。
作者:Yadollah Shahryary Dizaji [cre, aut]， Frank Johannes [aut]， Rashmi Hazarika [aut]
维护人:Yadollah Shahryary Dizaji < Shahryary at gmail.com>
引文(从R中输入引用(“AlphaBeta”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!#初始化BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("AlphaBeta")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“AlphaBeta”)
| R脚本 | AlphaBeta | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 表观遗传学,FunctionalGenomics,遗传学,MathematicalBiology,软件 |
| 版本 | 1.7.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0) |
| 进口 | dplyr(> = 0.7),data.table(> = 1.10),stringr(>= 0)， utils (>= 0)，gtools(> = 3.8.0),optimx(> = 2018 - 7.10),expm(>= 0.999-4)， stats (>= 3.6)，BiocParallel(> = 1.18),igraph(>= 1.2.4)， graphics (>= 3.6)，ggplot2grDevices (>= 3.2)， grDevices (>= 3.6)，情节(> = 4.9) |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | AlphaBeta_1.7.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13 (High Sierra) | AlphaBeta_1.7.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AlphaBeta |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AlphaBeta |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AlphaBeta/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
