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ASpli
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli
这是发展ASpli版本;稳定的发布版本请参见ASpli。
利用RNA-Seq分析选择性剪接
生物导体版本:开发(3.13)
整合管道的替代剪接分析使用RNAseq。
作者:Estefania Mancini, Andres Rabinovich, Javier Iserte, Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz
维护人员:Estefania Mancini
引文(从R中输入引用(“ASpli”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace(“BiocManager”，quiet = TRUE)) install.packages(“BiocManager”)#初始化BiocManager::install(“ASpli”)
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ASpli”)
| R脚本 | ASpli | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录 |
| 版本 | 2.1.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | grDevices, stats, utils, parallel，刨边机,limma,AnnotationDbi |
| 进口 | GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,Rsamtools,BiocStyle,igraph,htmltools,data.table,UpSetR,tidyr,DT,质量、网格图形 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | ASpli_2.1.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ASpli_2.1.1.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | ASpli_2.1.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ASpli |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
