Aspediafi

doi:10.18129/b9.bioc.aspediafi

这是发展Aspediafi的版本;对于稳定版本,请参阅Aspediafi

Aspedia-Fi:替代剪接事件的功能相互作用分析

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包为替代剪接事件及其功能相互作用的系统和集成分析提供了功能。

作者:Doyeong Yu,Kyubin Lee,Daejin Hyung,Soo Young Cho,Charny Park

维护者:doyeong yu

引用(从r内,输入引用(“ Aspediafi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ aspediafi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Aspediafi”)

PDF R脚本 aspediafi.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,注解,,,,覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,网络,,,,网络引导,,,,途径,,,,Reactome,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.11.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(3年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.6.0),总结性特征,,,,rocr
进口 生物比较,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,iranges,,,,IVAS,,,,rsamtools,,,,Biomart,,,,林玛,,,,S4VECTORS,统计绘制,,,,GenomeInfodB,,,,GVIZ,,,,矩阵,,,,dplyr,,,,fgsea,,,,RESHAPE2,,,,Igraph,图形,E1071, 方法,rtracklayer,,,,, 网格,GGPLOT2,mgsz,utils
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/nachoryu/aspediafi
取决于我
进口我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 aspediafi_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 aspediafi_1.11.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) aspediafi_1.11.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aspediafi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/aspediafi
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/aspediafi/
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