这是发展Aspediafi的版本;对于稳定版本,请参阅Aspediafi。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包为替代剪接事件及其功能相互作用的系统和集成分析提供了功能。
作者:Doyeong Yu,Kyubin Lee,Daejin Hyung,Soo Young Cho,Charny Park
维护者:doyeong yu
引用(从r内,输入引用(“ Aspediafi”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ aspediafi”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Aspediafi”)
R脚本 | aspediafi.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,注解,,,,覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,网络,,,,网络引导,,,,途径,,,,Reactome,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.11.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(3年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.6.0),总结性特征,,,,rocr |
进口 | 生物比较,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,iranges,,,,IVAS,,,,rsamtools,,,,Biomart,,,,林玛,,,,S4VECTORS,统计绘制,,,,GenomeInfodB,,,,GVIZ,,,,矩阵,,,,dplyr,,,,fgsea,,,,RESHAPE2,,,,Igraph,图形,E1071, 方法,rtracklayer,,,,秤, 网格,GGPLOT2,mgsz,utils |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/nachoryu/aspediafi |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | aspediafi_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | aspediafi_1.11.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | aspediafi_1.11.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aspediafi |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/aspediafi |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/aspediafi/ |
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