AMOUNTAIN

DOI:10.18129 / B9.bioc.AMOUNTAIN

这是发展AMOUNTAIN版本;稳定的发布版本,请参阅AMOUNTAIN。

积极为多层加权基因co-expression网络模块:一个连续优化的方法

Bioconductor版本:发展(3.17)

纯数据驱动基因网络,加权基因co-expression网络(WGCN)只能从构建表达谱。不同的层在这种网络可能代表不同的时间点,多个条件或不同的物种。在多层WGCN AMOUNTAIN旨在搜索活动模块使用一个连续的优化方法。

作者:李董,他掸,Zhisong锅和谷雨胡

维护人员:李董< dxl466在cs.bham.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“AMOUNTAIN”)

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文档

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HTML	R脚本	装饰图案的标题
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,微阵列,网络,软件
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3.0)
进口	统计数据
链接
建议	BiocStyle,qgraph,knitr,rmarkdown
SystemRequirements	gsl
增强了
URL
取决于我
进口我	这种款式
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AMOUNTAIN_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	AMOUNTAIN_1.25.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	AMOUNTAIN_1.25.0.tgz
macOS二进制(arm64)	AMOUNTAIN_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AMOUNTAIN
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AMOUNTAIN/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AMOUNTAIN/
包下载报告	下载数据