AHMassBank

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHMassBank

这是发展AHMassBank版本;稳定的发布版本,请参阅AHMassBank。

MassBank AnnotationHub注释参考资料

Bioconductor版本:发展(3.18)

供应AnnotationHub MassBank代谢物/复合注释捆绑在CompDb SQLite数据库。CompDb SQLite数据库包含一般复合注释以及化合物的离子碎片光谱代表分裂模式。从https://massbank MassBank检索数据。使用辅助函数从欧盟/ MassBank和加工CompoundDb Bioconductor包成可再发行的SQLite数据库。

作者:约翰Rainer (cre)

维护人员:约翰Rainer <约翰内斯。在eurac.edu Rainer >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“AHMassBank”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AHMassBank”)

HTML	R脚本	提供AnnotationHub EnsDb数据库
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationHubSoftware,MassSpectrometry,软件
版本	1.1.0
Bioconductor自	BioC 3.17 (r - 4.3)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2)
进口	AnnotationHubData(> = 1.5.24)
链接
建议	BiocStyleknitr,AnnotationHub(> = 2.7.13)rmarkdown、方法CompoundDb(> = 1.1.4)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jorainer/AHMassBank
BugReports	https://github.com/jorainer/AHMassBank/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AHMassBank_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	AHMassBank_1.1.0.zip
macOS二进制(x86_64)	AHMassBank_1.1.0.tgz
macOS二进制(arm64)	AHMassBank_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AHMassBank
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AHMassBank
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AHMassBank/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AHMassBank/
包下载报告	下载数据