ACME

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACME

这是发展ACME的版本;稳定的发布版本,请参阅ACME。

算法计算微阵列浓缩(ACME)

Bioconductor版本:发展(3.18)

ACME(算法计算微阵列浓缩)是一组工具分析花砖阵列芯片/芯片,DNAse过敏或其他实验,导致的基因组区域显示“浓缩”。它不依赖于一个特定的阵列技术(尽管数组应该是一个“瓷砖”数组),很一般(可应用于实验导致地区浓缩),和非常不敏感阵列噪音或归一化方法。也非常快,可以应用在全基因组花砖阵列实验很容易有足够的内存。

作者:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

维护人员:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“极致”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“极致”)

PDF	R脚本	ACME
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,归一化,软件,技术
版本	2.57.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(16岁)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10),Biobase(> = 2.5.5)、方法BiocGenerics
进口	图形、统计数据
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://watson.nci.nih.gov/ sdavis
取决于我
进口我
建议我	益生元
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ACME_2.57.0.tar.gz
Windows二进制	ACME_2.57.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	ACME_2.57.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ACME_2.57.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACME
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ACME
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ACME/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ACME/
包下载报告	下载数据