王牌

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACE

这是发展ACE版本;稳定版请参见王牌．

低覆盖率全基因组测序的绝对拷贝数估计

Bioconductor版本:开发(3.17)

利用分段拷贝数数据估计肿瘤细胞百分比，并产生显示绝对拷贝数的拷贝数图。

作者:Jos B Poell

维护者:Jos B Poell

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ACE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“王牌”)

超文本标记语言	R脚本	ACE装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，报道，DNASeq，测序，软件，可视化，WholeGenome
版本	1.17.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)
进口	Biobase，QDNAseq，ggplot2，网格，统计，utils，方法，grDevices，GenomicRanges
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tgac-vumc/ACE
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ACE_1.17.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ACE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ACE/
软件包下载报告	下载数据