命运

doi:10.18129/b9.bioc.destiny

创建扩散图

生物导体版本:版本(3.15)

创建和绘制扩散图。

作者:Philipp Angerer [CRE,AUT],Laleh Haghverdi [CTB],MarenBüttner[CTB],Fabian Theis [CTB],Carsten Marr [CTB],FlorianBüttner[CTB]

维护者:philipp angerer

引用(从r内,输入引用(“命运”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ destiny”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“命运”)

html R脚本 命运2.0带来了扩散伪时间(DPT)类
html R脚本 命运主小插图:从这里开始!
html R脚本 用命运3检测相关基因3
html R脚本 用提供的数据()重现扩散地图小插图
html R脚本 全球与本地内核的影响
html R脚本 与命运的整合和ggplot集成
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,软件,,,,可视化
版本 3.10.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4.0)
进口 方法,图形,grdevices,网格,utils,stats,矩阵,,,,RCPP(> = 0.10.3),rcppeigen,,,,rspectra(> = 0.14-0),irlba,,,,pcamethods,,,,生物酶,,,,生物基因,,,,总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,GGPLOT2,,,,ggplot.multistats,,,,花花公子,,,,tidyselect,,,,ggthemes,,,,vim,,,,Knn.Covertree,,,,代理人,,,,rcpphnsw,,,,更光滑,,,,,,,,STACTPLOT3D
链接 RCPP,,,,rcppeigen,grdevices
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,Igraph,,,,测试,,,,fnn,,,,平淡无奇,,,,栅格,,,,牛仔图,,,,冲突,,,,维里迪斯,,,,RGL,,,,scrnaseq,,,,org.mm.eg.db,,,,斯克兰,,,,ret
系统要求 C ++ 11
增强 RGL,,,,Singlecellexperiment
URL https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.anjoumacpherson.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715
BugReports https://github.com/theislab/destiny/issues
取决于我
进口我 细胞动力,,,,Phemd
建议我 细胞体,,,,蜂窝轨道,,,,单片
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 destiny_3.10.0.tar.gz
Windows二进制 destiny_3.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) destiny_3.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/命运
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/destiny/
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