生物导体版本:版本(3.15)
创建和绘制扩散图。
作者:Philipp Angerer [CRE,AUT],Laleh Haghverdi [CTB],MarenBüttner[CTB],Fabian Theis [CTB],Carsten Marr [CTB],FlorianBüttner[CTB]
维护者:philipp angerer
引用(从r内,输入引用(“命运”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ destiny”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“命运”)
html | R脚本 | 命运2.0带来了扩散伪时间(DPT)类 |
html | R脚本 | 命运主小插图:从这里开始! |
html | R脚本 | 用命运3检测相关基因3 |
html | R脚本 | 用提供的数据()重现扩散地图小插图 |
html | R脚本 | 全球与本地内核的影响 |
html | R脚本 | 与命运的整合和ggplot集成 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 3.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | 方法,图形,grdevices,网格,utils,stats,矩阵,,,,RCPP(> = 0.10.3),rcppeigen,,,,rspectra(> = 0.14-0),irlba,,,,pcamethods,,,,生物酶,,,,生物基因,,,,总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,GGPLOT2,,,,ggplot.multistats,,,,花花公子,,,,tidyselect,,,,ggthemes,,,,vim,,,,Knn.Covertree,,,,代理人,,,,rcpphnsw,,,,更光滑,,,,秤,,,,STACTPLOT3D |
链接 | RCPP,,,,rcppeigen,grdevices |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,Igraph,,,,测试,,,,fnn,,,,平淡无奇,,,,栅格,,,,牛仔图,,,,冲突,,,,维里迪斯,,,,RGL,,,,scrnaseq,,,,org.mm.eg.db,,,,斯克兰,,,,ret |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | RGL,,,,Singlecellexperiment |
URL | https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.anjoumacpherson.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715 |
BugReports | https://github.com/theislab/destiny/issues |
取决于我 | |
进口我 | 细胞动力,,,,Phemd |
建议我 | 细胞体,,,,蜂窝轨道,,,,单片 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | destiny_3.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | destiny_3.10.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | destiny_3.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/命运 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/destiny/ |
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