derfinderPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.derfinderPlot

derfinder绘图函数

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包为derfinder包的结果提供了绘图函数。这有助于将制作这些图所需的图形依赖关系与derfinder的核心功能分开。

作者:Leonardo Collado-Torres [aut, cre]——安德鲁·e·杰夫[au]， Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护者:Leonardo Collado-Torres

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“derfinderPlot”)

超文本标记语言	R脚本	derfinderPlot简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，可视化
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.2)
进口	derfinder(> = 1.1.0版),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures，GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2，图形，grDevices，IRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr，RColorBrewer，reshape2，S4Vectors(> = 0.9.38),尺度,跑龙套
链接
建议	biovizBase(> = 1.27.2),bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),sessioninfo，knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db，RefManageR，rmarkdown(> = 0.3.3),testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/derfinderPlot
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot
全靠我
进口我	brainflowprobes，recountWorkflow
建议我	derfinder，GenomicState，regionReport
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	derfinderPlot_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	derfinderPlot_1.32.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	derfinderPlot_1.32.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	derfinderPlot_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/derfinderPlot
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/derfinderPlot/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/
软件包下载报告	下载数据