dagLogo

DOI:10.18129 / B9.bioc.dagLogo

dagLogo:一个Bioconductor包,用于基于概率论在组中可视化保守的氨基酸序列模式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

以概率论为基础,将组内显著保守的氨基酸序列模式可视化。

作者:欧建宏,刘海波,Alexey Stukalov, Niraj Nirala, Usha Acharya,朱丽华Julie

维护者:欧建宏<建宏。你在duke.edu>

引文(从R内,输入引用(“dagLogo”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“dagLogo”)

超文本标记语言 R脚本 dagLogo装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews SequenceMatching软件可视化
版本 1.36.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 3.0.1),方法,网格
进口 pheatmapBiostringsUniProt.wsBiocGenerics跑龙套,biomaRtmotifStackhttr
链接
建议 XMLgrImportgrImport2BiocStyleknitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 dagLogo_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 dagLogo_1.36.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) dagLogo_1.36.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) dagLogo_1.36.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dagLogo
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dagLogo
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/dagLogo/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dagLogo/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网