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csdR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.csdR
差异基因co-expression
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包包含在两种不同条件下运行差异基因共表达的功能。该算法受到Voigt等人的启发，发现了保守、特异和分化的基因(因此得名CSD)。该软件包包括通过自举和Welford算法进行的高效和方差计算。
作者:Jakob Peder Pettersen
维护者:Jakob Peder Pettersen
引用(从R中，输入引用(“csdR”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("csdR")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“csdR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | csdR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression，GeneExpression，GraphAndNetwork，网络，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.1.0) |
| 进口 | WGCNA，胶水，RhpcBLASctl，matrixStats，Rcpp |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | rmarkdown，knitr，testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，magrittr，igraph，dplyr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://almaaslab.github.io/csdRhttps://github.com/AlmaasLab/csdR |
| BugReports | https://github.com/AlmaasLab/csdR/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | csdR_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | csdR_1.4.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | csdR_1.4.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | csdR_1.3.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csdR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ csdR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/csdR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
