- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- countsimQC
countsimQC
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.countsimQC
比较统计数据集的特征
Bioconductor版本:版本(3.17)
countsimQC提供功能来创建一个全面的报告比较广泛的跨数的集合特征矩阵。一个重要的用例是一个或多个合成数矩阵的比较实际数矩阵,这也许是一个潜在的模拟。然而,任何数矩阵可以比较的集合。
作者:夏洛特Soneson (aut (cre)
维护人员:夏洛特Soneson < charlottesoneson gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“countsimQC”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“countsimQC”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“countsimQC”)
| HTML | R脚本 | countsimQC用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentalDesign,ImmunoOncology,微生物组,质量控制,RNASeq,ReportWriting,SingleCell,软件,可视化 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | rmarkdown (> = 2.5),刨边机,DESeq2(> = 1.16.0)dplyr、tidyr ggplot2, grDevices,工具,SummarizedExperiment,genefilter,DT,GenomeInfoDbData跑龙套,randtests caTools统计数据,方法,ragg |
| 链接 | |
| 建议 | knitr, testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/csoneson/countsimQC |
| BugReports | https://github.com/csoneson/countsimQC/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 马斯喀特 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | countsimQC_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | countsimQC_1.18.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | countsimQC_1.18.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | countsimQC_1.17.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/countsimQC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ countsimQC |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/countsimQC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/countsimQC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
