- 首页
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- cosmosR
cosmosR
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmosR
COSMOS(因果导向的多组空间搜索)
Bioconductor版本:发行版(3.16)
COSMOS(因果导向的多组空间搜索)是一种基于信号、代谢和基因调控网络的先验知识，集成磷蛋白组学、转录组学和代谢组学数据集的方法。它估计了转录因子和激酶的活性，并发现了网络水平的因果推理。因此，COSMOS为跨多组学数据集的实验观测提供了机制假设。
作者:Aurélien Dugourd [aut]
，阿提拉·加伯[cre]，卡塔琳娜·齐恩布尔[au]
维护者:Attila Gabor < Attila。Gabor在uni-heidelberg.de>
引文(从R内，输入引用(“cosmosR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“cosmosR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | cosmosR教程 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | CellBiology，GeneSignaling，代谢组学，网络，通路，蛋白质组学，软件，转录组 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | 狂欢节，多萝西娅，dplyr，GSEABase，igraph，进步，purrr，rlang，stringr跑龙套,visNetwork |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown，钢琴，ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/COSMOSR |
| BugReports | https://github.com/saezlab/COSMOSR/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | cosmosR_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cosmosR_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | cosmosR_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | cosmosR_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmosR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cosmosR |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cosmosR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cosmosR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
