调味品

DOI:10.18129 / B9.bioc.condiments

微分拓扑，级数和微分

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包封装了许多函数来进行微分拓扑分析。它侧重于分析具有多个条件的“omic数据集”。虽然这个包主要面向scRNASeq，但它对实际的输入格式没有任何限制。

作者:Hector Roux de Bezieux [aut, cre]， Koen Van den Berge [aut, ctb]， Kelly Street [aut, ctb]

维护者:Hector Roux de Bezieux < Hector。Rouxdebezieux在berkeley.edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

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细节

biocViews	MultipleComparison，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)
进口	弹弓(> = 1.9),mgcv，RANN统计数据,SingleCellExperiment，SummarizedExperiment跑龙套,magrittr，dplyr(> = 1.0),Ecume(>= 0.9.1)，方法pbapply，matrixStats，BiocParallel，TrajectoryUtils，igraph，截然不同的
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown，covr，冬青，ggplot2，RColorBrewer，randomForest，tidyr，TSCAN
SystemRequirements
增强了
URL	https://hectorrdb.github.io/condiments/index.html
BugReports	https://github.com/HectorRDB/condiments/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	condiments_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	condiments_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	condiments_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	condiments_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/condiments
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:包/调味品
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/condiments/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/condiments/
软件包下载报告	下载数据