compEpiTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.compEpiTools

工具计算表观基因组学

Bioconductor版本:版本(3.17)

分析计算表观基因组学工具开发,集成和同步可视化的各种跨多个基因组(epi)基因组学数据类型地区多个样本。

作者:马狄亚(aut),卡基肖尔(aut) Mattia可•福尔兰正(施,cre)

维护人员:Mattia可•福尔兰正< Mattia。可•福尔兰正在iit.it >

从内部引用(R,回车引用(“compEpiTools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“compEpiTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“compEpiTools”)

PDF R脚本 compEpiTools.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 报道,GeneExpression,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化
版本 1.34.1
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年)
许可证 GPL
取决于 R(> = 3.5.0)、方法topGO,GenomicRanges
进口 AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,Rsamtools、平行、grDevices gplots,IRanges,GenomicFeatures,XVector,methylPipe,GO.db,S4Vectors,GenomeInfoDb
链接
建议 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,org.Mm.eg.dbknitr,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 compEpiTools_1.34.1.tar.gz
Windows二进制 compEpiTools_1.34.1.zip
macOS二进制(x86_64) compEpiTools_1.34.1.tgz
macOS二进制(arm64) compEpiTools_1.34.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compEpiTools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ compEpiTools
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/compEpiTools/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/compEpiTools/
包下载报告 下载数据
老BioC 3.17源码包 源存档

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网