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警戒线
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DOI:10.18129 / B9.bioc.coRdon
密码子使用基因表达性的分析和预测
Bioconductor版本:版本(3.17)
密码子使用的工具分析各种未经或KEGG /齿轮带注释的DNA序列。计算不同措施的铜偏差和预测基因的表现度,可见光谱线并执行基因集富集分析带注释的序列。实现了几种方法对铜和富集分析结果的可视化。
作者:Anamaria Elek (cre, aut], Maja Kuzman (aut),克里斯蒂安Vlahovicek (aut)
维护人员:Anamaria Elek < anamariaelek gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“警戒线”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“警戒线”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“警戒线”)
| HTML | R脚本 | 警戒线 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,GeneExpression,GenePrediction,GeneSetEnrichment,遗传学CellBiology,ImmunoOncology,KEGG,宏基因组,通路,软件,可视化 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | 方法、统计跑龙套,Biostrings,Biobase,stringr dplyr purrr、ggplot2 data.table |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr testthat rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/BioinfoHR/coRdon |
| BugReports | https://github.com/BioinfoHR/coRdon/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | vhcub |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | coRdon_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | coRdon_1.18.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | coRdon_1.18.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | coRdon_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coRdon |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/警戒线 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/coRdon/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/coRdon/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
