chimeraviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimeraviz

基因融合的可视化工具

Bioconductor版本:版本(3.17)

chimeraviz管理数据融合基因发现者和提供有用的可视化工具。

作者:Stian Lagstad (aut (cre)森赵(施),安德烈亚斯·m·霍夫(施),Bjarne Johannessen[所有],Ole基督教Lingjærde[所有],Rolf Skotheim(施)

维护人员:Stian Lagstad < stianlagstad gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“chimeraviz”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chimeraviz”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chimeraviz”)

HTML R脚本 chimeraviz
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,基础设施,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biostrings,GenomicRanges,IRanges,Gviz,S4Vectors,ensembldb,AnnotationFilter,data.table
进口 方法、网格Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicAlignmentsRColorBrewer图形,AnnotationDbiRCircos,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.dbrmarkdown,,Rgraphviz,DT, plyr dplyr,BiocStyle将军,gtools魔法
链接
建议 testthat、roxygen2 devtools、knitr lintr
SystemRequirements 领结,samtools egrep所需的一些功能
增强了
URL https://github.com/stianlagstad/chimeraviz
BugReports https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 chimeraviz_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 chimeraviz_1.26.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) chimeraviz_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) chimeraviz_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chimeraviz
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/chimeraviz/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/
包下载报告 下载数据

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