cellmigRation

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellmigRation

跟踪单元,分析单元轨迹和计算迁移统计数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

导入荧光标记细胞的TIFF图像,并跟踪细胞随时间的移动。并行化支持图像处理和快速计算单元轨迹。通过15个轨迹分析功能,可以对细胞轨迹进行深入分析。

作者:Salim Ghannoum [aut, cph], Damiano Fantini [aut, cph], Waldir Leoncio [cre, aut], Øystein Sørensen [aut]

维护者:Waldir Leoncio

引文(从R内,输入引用(“cellmigRation”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cellmigRation”)

超文本标记语言 R脚本 cellmigRation
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细节

biocViews CellBiologyDataImportDataRepresentation软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R(>= 4.1),方法,foreach
进口 tiff,图形,统计,utils,reshape2平行,doParallelgrDevices,matrixStatsFMESpatialToolsspvioplotFactoMineRHmisc
链接
建议 knitrrmarkdowndplyrggplot2RUnitBiocGenericsBiocManagerkableExtrargl
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ocbe-uio/cellmigRation/
BugReports https://github.com/ocbe-uio/cellmigRation/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 cellmigRation_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 cellmigRation_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) cellmigRation_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) cellmigRation_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellmigRation
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cellmigRation
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cellmigRation/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cellmigRation/
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