- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- celaref
celaref
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DOI:10.18129 / B9.bioc.celaref
单细胞RNAseq细胞集群通过引用标签
Bioconductor版本:版本(3.17)
单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后,这个计划的目的是建议标签/细胞类型的集群,相似性的基础上,参考数据集。它需要读表数每细胞基因,和一系列的细胞属于每个集群,(用于测试和参考数据)。
作者:莎拉·威廉姆斯(aut (cre)
维护人员:莎拉·威廉姆斯<萨拉。在monash.edu williams1 >
从内部引用(R,回车引用(“celaref”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“celaref”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“celaref”)
| HTML | R脚本 | 手册 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment |
| 进口 | 桅杆,矩阵ggplot2 dplyr magrittr,统计,跑龙套,rlang,BiocGenerics,S4Vectorsreadr宠物猫,DelayedArray |
| 链接 | |
| 建议 | limma、平行、knitr rmarkdown,ExperimentHub,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | celaref_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | celaref_1.18.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | celaref_1.18.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | celaref_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ celaref |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/celaref/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/celaref/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
