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bugsigdbr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.bugsigdbr
r端访问来自BugSigDB的已发表微生物特征
Bioconductor版本:发行版(3.16)
bugsigdbr包实现了从R/Bioconductor内部方便地访问bugsigdb.org。该软件包的目标是方便将BugSigDB数据导入R/Bioconductor，提供提取微生物特征的实用程序，并支持将提取的特征以标准文件格式(如GMT)导出为纯文本文件。
作者:Ludwig Geistlinger [aut, cre]， Jennifer Wokaty [aut]， Levi Waldron [aut]
维护者:Ludwig Geistlinger
引文(从R内，输入引用(“bugsigdbr”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bugsigdbr")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“bugsigdbr”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 对BugSigDB的r端访问 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport，GeneSetEnrichment，宏基因组，微生物组，软件 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | BiocFileCache、方法、发呜呜声,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，ontologyIndex，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/waldronlab/bugsigdbr |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/bugsigdbr/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | bugsigdbr_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | bugsigdbr_1.4.1.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | bugsigdbr_1.4.1.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | bugsigdbr_1.4.1.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bugsigdbr |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bugsigdbr |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bugsigdbr/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
