咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

聚类算法Bioconductor

Bioconductor版本:版本(3.16)

包装一个容易扩展S4框架中常用的聚类算法。后端实现分层,k - means和图论聚类。几个实用程序还提供了比较和评价聚类结果。

作者:亚伦Lun (aut (cre),斯蒂芬妮·希克斯(施)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“咆哮”)

HTML	R脚本	1。聚类算法
HTML	R脚本	2。聚类诊断
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,ImmunoOncology,SingleCell,软件,转录组
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	属性、方法、效用,集群,矩阵,Rcpp,igraph,S4Vectors,BiocParallel,BiocNeighbors
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,dynamicTreeCut,scRNAseq,天窗,嘘,食物,pheatmap,冬青,mbkmeans,kohonen,apcluster
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我	OSCA。先进,OSCA。基本、OSCA.intro OSCA。multisample OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	scDblFinder,食物,“航行者”号
建议我	后面;,ChromSCape,dittoSeq,mbkmeans,mumosa
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bluster_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	bluster_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bluster_1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64)	bluster_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bluster/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/
包下载报告	下载数据