Bioconductor版本:发行版(3.16)
biodbKegg库是biodb框架包的扩展,提供访问KEGG数据库化合物,酶,基因,模块,Orthology和反应。它允许根据条目的登录号检索条目。像“查找”、“列表”和“findExactMass”这样的Web服务也可用。还实现了一些沿着路径导航的功能。
维护者:Pierrick Roger < Pierrick。收到,在cea.fr>
引文(从R内,输入引用(“biodbKegg”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biodbKegg”)
超文本标记语言 | R脚本 | 介绍biodbKegg包。 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,KEGG,通路,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
许可证 | AGPL-3 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | R6,biodb(> = 1.4.2),嗯,生命周期 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,roxygen2,devtools,testthat(> = 2.0.0),knitr,rmarkdown,igraph,魔法,lgr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pkrog/biodbKegg |
BugReports | https://github.com/pkrog/biodbKegg/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | biodbKegg_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | biodbKegg_1.4.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | biodbKegg_1.4.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbKegg |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biodbKegg |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biodbKegg/ |
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