Bioconductor 1.7包

版本 标题
aCGH 1.4.1 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。
affxparser 1.2.0 Affymetrix文件解析SDK
affy 1.8.1 Affymetrix寡核苷酸阵列方法
affycomp 1.6.0 图形工具箱评估Affymetrix表达措施
affydata 1.6.0 用于演示目的的Affymetrix数据
affylmGUI 1.4.0 图形用户界面的affy分析使用limma包
affypdnn 1.4.0 探测依赖最近邻(PDNN)的affy包
affyPLM 1.6.0 拟合探针级模型的方法
affyQCReport 1.8.0 生成affyBatch对象的QC报告
altcdfenvs 1.4.0 替代cdfenvs
annaffy 1.2.0 注释工具Affymetrix生物元数据
AnnBuilder 1.8.0 Bioconductor注释数据包生成器
注释 1.8.0 微阵列注释
apComplex 1.4.0 使用AP-MS蛋白数据估计蛋白复合体成员
arrayMagic 1.8.0 双色cDNA阵列质量控制及预处理
arrayQuality 1.4.0 点阵阵列质量评估
荡妇 1.2.0 贝叶斯间隔映射诊断
Biobase 1.8.0 生物基:生物导体的基础功能
bioDist 1.2.0 不同的距离测量
biomaRt 1.4.0 与BioMart数据库的接口(例如Ensembl)
Biostrings 1.4.0 表示生物序列的字符串对象
1.2.0 差异基因表达的贝叶斯鲁棒推断
类别 1.2.0 类别分析
ChromoViz 1.2.0 基因表达数据的多模式可视化
clusterStab 1.2.0 计算微阵列数据的集群稳定性分数
CoCiteStats 1.2.0 基于共引的不同检验统计量。
转换 1.4.0 转换微阵列数据对象
ctc 1.4.0 集群和树的转换。
daMA 1.2.0 析因双色微阵列数据的有效设计与分析
DEDS 1.2.2 微阵列数据的距离汇总差分表达
diffGeneAnalysis 1.12.0 进行差异基因表达分析
DNAcopy 1.4.0 DNA拷贝数数据分析
DynDoc 1.8.0 动态文档工具
EBarrays 1.2.0 微阵列的经验贝叶斯
ecolitk 1.2.0 大肠杆菌的元数据和工具
edd 1.8.0 表达密度诊断
externalVector 1.2.0 向量对象的R与外部存储
factDesign 1.4.0 析因设计微阵列实验分析
fdrame 1.2.0 微阵列实验的FDR调整(FDR- ame)
gcrma 2.2.1 使用序列信息进行背景调整
genArise 1.6.0 微阵列分析工具
genefilter 1.8.0 genfilter:过滤基因
GeneMeta 1.2.0 高通量实验荟萃分析
geneplotter 1.8.0 Bioconductor的图形相关功能
总的来说 1.4.2 R表示基因和序列分析
geneRecommender 1.2.0 一种基因推荐算法,用于识别与基因查询集共表达的基因
GeneSpring 2.2.0 genesspring R集成函数
GeneTraffic 1.2.0 GeneTraffic R集成功能
麝猫 2.8.0 微阵列时间序列和网络分析
gff3Plotter 1.4.0 基因组布局实验数据绘制
很高兴 1.2.0 DNA的得失分析
GlobalAncova 1.4.0 计算组间差异基因表达的全局测试
globaltest 3.2.0 一组基因与临床变量的相关性检测
goCluster 1.4.0 结合注释数据分析聚类结果。
GOstats 1.4.0 操作氧化石墨烯和微阵列的工具。
goTools 1.2.0 基因本体数据库的功能
gpl 1.2.0 用广义偏最小二乘进行分类
1.8.0 一个处理图形数据结构的包
GraphAT 1.2.0 图论关联测验
哼哼 1.2.0 多条件下鉴别差异表达基因的异质误差模型
hexbin 1.4.0 六边形装箱例程
hopach 1.4.0 分层有序分区和压缩混合(HOPACH)
超图 1.2.0 一个提供超图数据结构的包
Icens 1.2.0 删减和截断数据的NPMLE
表意文字 1.4.0 表意文字
嫁祸于 1.2.0 impute:微阵列数据的输入
iSPlot 1.2.0 连接图
KEGGSOAP 1.4.0 客户端SOAP访问KEGG
limma 2.2.0 微阵列数据的线性模型
limmaGUI 1.6.0 limma包的GUI
简述 1.4.0 局部池误差(LPE)方法分析微阵列数据的方法
maanova 1.0.0 分析微阵列实验的工具
macat 1.4.0 微阵列染色体分析工具
时间的 1.2.0 微阵列数据库和实用程序功能用于微阵列分析。
made4 1.4.0 使用ADE4对微阵列数据进行多变量分析
makecdfenv 1.8.0 CDF环境制作器
庄园 1.2.0 微阵列正常化
marray 1.8.0 双色斑点微阵列数据的探索性分析
maSigPro 1.2.0 基因表达谱在时序芯片数据中的显著差异
matchprobes 1.2.1 " 用于阵列探针序列匹配的工具
MCRestimate 1.4.0 交叉验证的误分类误差估计
MeasurementError.cor 1.2.0 相关系数的测量误差模型估计
MergeMaid 2.2.0 合并女仆
MiPP 1.2.0 误分类,后分类
MLInterfaces 1.2.1 " 统一接口到R机器学习程序的数据在Bioconductor容器
mmgmos 1.2.0 多芯片改进的寡核苷酸信号伽玛模型
msbase 1.4.0 质谱质量表操作的基本类和方法。
1.8.0 基于重采样的多重假设检验
nnNorm 1.4.0 基于鲁棒神经网络的cDNA微阵列数据空间和强度归一化
奥林 1.6.0 优化双色微阵列的局部强度依赖归一化
OLINgui 1.4.0 图形用户界面的OLIN
ontoTools 1.6.0 处理本体的图和稀疏矩阵;用于具有出处管理的命名法的形式化对象
pairseqsim 1.4.0 两两序列比对相似性简单。
pamr 1.28.0 微阵列预测分析
pdmclass 1.2.0 基于惩罚判别方法的微阵列样本分类
pgUtils 1.2.0 PostgreSQL数据库的实用函数
pickgene 1.2.0 微阵列表达数据分析的自适应基因选择
plgem 1.2.0 幂律全局误差模型
钳子 1.2.0 实现Affymetrix PLIER算法
普拉达 1.6.3 基于细胞功能分析的数据分析
过程 1.6.3 Ciphergen SELDI-TOF处理
qvalue 1.4.0 错误发现率控制的q值估计
罗摩 1.2.0 微阵列鲁棒性分析
RankProd 1.2.0 Rank Product法鉴别差异表达基因。
RBGL 1.6.0 测试接口,以提高c++图形库
Rdbi 1.4.0 通用数据库方法
RdbiPgSQL 1.4.0 PostgreSQL访问
犹太人的尊称 1.2.0 地域表达偏见
reposTools 1.8.0 R的存储库工具
Resourcerer 1.4.0 从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为Bioconductor数据包。
rfcdmin 1.2.0 最小的数据库为RFlowCyt的例子
rflowcyt 1.2.0 分析流式细胞术的统计工具和数据结构
Rgraphviz 1.8.0 为R图形对象提供绘图功能
rhdf5 1.6.0 R的HDF5接口
RMAGEML 测试盒框 处理MAGEML文档
中华民国 1.4.0 用于ROC的实用程序,以数组为重点
RSNPper 1.2.0 接口到chip.org::SNPper获取snp相关数据
Ruuid 1.8.0 Ruuid:提供通用唯一的ID值
安全 1.2.0 功能与表达的意义分析
SAGElyzer 1.8.0 一个处理SAGE库的包
sagenhaft 1.2.0 用于读取和比较SAGE库的函数集合
SBMLR 1.24.0 SBML-R接口和分析工具
siggenes 1.4.0 SAM和Efron的经验贝叶斯方法
simpleaffy 2.4.2 非常简单的高层次分析Affymetrix数据
simulatorAPMS 1.2.1 " 计算模拟AP-MS技术。
SNAData 1.4.0 社交网络分析数据示例
splicegear 1.2.0 splicegear
spotSegmentation 1.2.0 微阵列斑点块分割与网格划分
ssize 1.2.0 估计微阵列样本量
斯塔姆 1.2.0 微阵列数据的结构化分析
stepNorm 1.2.0 cDNA微阵列的逐步归一化函数
tilingArray 1.2.0 平铺阵列分析
timecourse 1.2.0 发育微阵列时间过程数据的统计分析
tkWidgets 1.8.0 基于R的tk小部件
《暮光之城》 1.4.0 局部错误发现率的估计
vsn 1.8.0 微阵列数据的方差稳定和校准
webbioc 1.2.0 生物导体网络接口
widgetInvoke 1.2.0 函数的评估小部件
widgetTools 1.6.0 创建一个交互式tcltk小部件
xcms 1.2.0 LC/MS和GC/MS数据分析