包 |
版本 |
标题 |
aCGH |
1.4.1 |
阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
affxparser |
1.2.0 |
Affymetrix文件解析SDK |
affy |
1.8.1 |
Affymetrix寡核苷酸阵列方法 |
affycomp |
1.6.0 |
图形工具箱评估Affymetrix表达措施 |
affydata |
1.6.0 |
用于演示目的的Affymetrix数据 |
affylmGUI |
1.4.0 |
图形用户界面的affy分析使用limma包 |
affypdnn |
1.4.0 |
探测依赖最近邻(PDNN)的affy包 |
affyPLM |
1.6.0 |
拟合探针级模型的方法 |
affyQCReport |
1.8.0 |
生成affyBatch对象的QC报告 |
altcdfenvs |
1.4.0 |
替代cdfenvs |
annaffy |
1.2.0 |
注释工具Affymetrix生物元数据 |
AnnBuilder |
1.8.0 |
Bioconductor注释数据包生成器 |
注释 |
1.8.0 |
微阵列注释 |
apComplex |
1.4.0 |
使用AP-MS蛋白数据估计蛋白复合体成员 |
arrayMagic |
1.8.0 |
双色cDNA阵列质量控制及预处理 |
arrayQuality |
1.4.0 |
点阵阵列质量评估 |
荡妇 |
1.2.0 |
贝叶斯间隔映射诊断 |
Biobase |
1.8.0 |
生物基:生物导体的基础功能 |
bioDist |
1.2.0 |
不同的距离测量 |
biomaRt |
1.4.0 |
与BioMart数据库的接口(例如Ensembl) |
Biostrings |
1.4.0 |
表示生物序列的字符串对象 |
桥 |
1.2.0 |
差异基因表达的贝叶斯鲁棒推断 |
类别 |
1.2.0 |
类别分析 |
ChromoViz |
1.2.0 |
基因表达数据的多模式可视化 |
clusterStab |
1.2.0 |
计算微阵列数据的集群稳定性分数 |
CoCiteStats |
1.2.0 |
基于共引的不同检验统计量。 |
转换 |
1.4.0 |
转换微阵列数据对象 |
ctc |
1.4.0 |
集群和树的转换。 |
daMA |
1.2.0 |
析因双色微阵列数据的有效设计与分析 |
DEDS |
1.2.2 |
微阵列数据的距离汇总差分表达 |
diffGeneAnalysis |
1.12.0 |
进行差异基因表达分析 |
DNAcopy |
1.4.0 |
DNA拷贝数数据分析 |
DynDoc |
1.8.0 |
动态文档工具 |
EBarrays |
1.2.0 |
微阵列的经验贝叶斯 |
ecolitk |
1.2.0 |
大肠杆菌的元数据和工具 |
edd |
1.8.0 |
表达密度诊断 |
externalVector |
1.2.0 |
向量对象的R与外部存储 |
factDesign |
1.4.0 |
析因设计微阵列实验分析 |
fdrame |
1.2.0 |
微阵列实验的FDR调整(FDR- ame) |
gcrma |
2.2.1 |
使用序列信息进行背景调整 |
genArise |
1.6.0 |
微阵列分析工具 |
genefilter |
1.8.0 |
genfilter:过滤基因 |
GeneMeta |
1.2.0 |
高通量实验荟萃分析 |
geneplotter |
1.8.0 |
Bioconductor的图形相关功能 |
总的来说 |
1.4.2 |
R表示基因和序列分析 |
geneRecommender |
1.2.0 |
一种基因推荐算法,用于识别与基因查询集共表达的基因 |
GeneSpring |
2.2.0 |
genesspring R集成函数 |
GeneTraffic |
1.2.0 |
GeneTraffic R集成功能 |
麝猫 |
2.8.0 |
微阵列时间序列和网络分析 |
gff3Plotter |
1.4.0 |
基因组布局实验数据绘制 |
很高兴 |
1.2.0 |
DNA的得失分析 |
GlobalAncova |
1.4.0 |
计算组间差异基因表达的全局测试 |
globaltest |
3.2.0 |
一组基因与临床变量的相关性检测 |
goCluster |
1.4.0 |
结合注释数据分析聚类结果。 |
GOstats |
1.4.0 |
操作氧化石墨烯和微阵列的工具。 |
goTools |
1.2.0 |
基因本体数据库的功能 |
gpl |
1.2.0 |
用广义偏最小二乘进行分类 |
图 |
1.8.0 |
一个处理图形数据结构的包 |
GraphAT |
1.2.0 |
图论关联测验 |
哼哼 |
1.2.0 |
多条件下鉴别差异表达基因的异质误差模型 |
hexbin |
1.4.0 |
六边形装箱例程 |
hopach |
1.4.0 |
分层有序分区和压缩混合(HOPACH) |
超图 |
1.2.0 |
一个提供超图数据结构的包 |
Icens |
1.2.0 |
删减和截断数据的NPMLE |
表意文字 |
1.4.0 |
表意文字 |
嫁祸于 |
1.2.0 |
impute:微阵列数据的输入 |
iSPlot |
1.2.0 |
连接图 |
KEGGSOAP |
1.4.0 |
客户端SOAP访问KEGG |
limma |
2.2.0 |
微阵列数据的线性模型 |
limmaGUI |
1.6.0 |
limma包的GUI |
简述 |
1.4.0 |
局部池误差(LPE)方法分析微阵列数据的方法 |
maanova |
1.0.0 |
分析微阵列实验的工具 |
macat |
1.4.0 |
微阵列染色体分析工具 |
时间的 |
1.2.0 |
微阵列数据库和实用程序功能用于微阵列分析。 |
made4 |
1.4.0 |
使用ADE4对微阵列数据进行多变量分析 |
makecdfenv |
1.8.0 |
CDF环境制作器 |
庄园 |
1.2.0 |
微阵列正常化 |
marray |
1.8.0 |
双色斑点微阵列数据的探索性分析 |
maSigPro |
1.2.0 |
基因表达谱在时序芯片数据中的显著差异 |
matchprobes |
1.2.1 " |
用于阵列探针序列匹配的工具 |
MCRestimate |
1.4.0 |
交叉验证的误分类误差估计 |
MeasurementError.cor |
1.2.0 |
相关系数的测量误差模型估计 |
MergeMaid |
2.2.0 |
合并女仆 |
MiPP |
1.2.0 |
误分类,后分类 |
MLInterfaces |
1.2.1 " |
统一接口到R机器学习程序的数据在Bioconductor容器 |
mmgmos |
1.2.0 |
多芯片改进的寡核苷酸信号伽玛模型 |
msbase |
1.4.0 |
质谱质量表操作的基本类和方法。 |
乘 |
1.8.0 |
基于重采样的多重假设检验 |
nnNorm |
1.4.0 |
基于鲁棒神经网络的cDNA微阵列数据空间和强度归一化 |
奥林 |
1.6.0 |
优化双色微阵列的局部强度依赖归一化 |
OLINgui |
1.4.0 |
图形用户界面的OLIN |
ontoTools |
1.6.0 |
处理本体的图和稀疏矩阵;用于具有出处管理的命名法的形式化对象 |
pairseqsim |
1.4.0 |
两两序列比对相似性简单。 |
pamr |
1.28.0 |
微阵列预测分析 |
pdmclass |
1.2.0 |
基于惩罚判别方法的微阵列样本分类 |
pgUtils |
1.2.0 |
PostgreSQL数据库的实用函数 |
pickgene |
1.2.0 |
微阵列表达数据分析的自适应基因选择 |
plgem |
1.2.0 |
幂律全局误差模型 |
钳子 |
1.2.0 |
实现Affymetrix PLIER算法 |
普拉达 |
1.6.3 |
基于细胞功能分析的数据分析 |
过程 |
1.6.3 |
Ciphergen SELDI-TOF处理 |
qvalue |
1.4.0 |
错误发现率控制的q值估计 |
罗摩 |
1.2.0 |
微阵列鲁棒性分析 |
RankProd |
1.2.0 |
Rank Product法鉴别差异表达基因。 |
RBGL |
1.6.0 |
测试接口,以提高c++图形库 |
Rdbi |
1.4.0 |
通用数据库方法 |
RdbiPgSQL |
1.4.0 |
PostgreSQL访问 |
犹太人的尊称 |
1.2.0 |
地域表达偏见 |
reposTools |
1.8.0 |
R的存储库工具 |
Resourcerer |
1.4.0 |
从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为Bioconductor数据包。 |
rfcdmin |
1.2.0 |
最小的数据库为RFlowCyt的例子 |
rflowcyt |
1.2.0 |
分析流式细胞术的统计工具和数据结构 |
Rgraphviz |
1.8.0 |
为R图形对象提供绘图功能 |
rhdf5 |
1.6.0 |
R的HDF5接口 |
RMAGEML |
测试盒框 |
处理MAGEML文档 |
中华民国 |
1.4.0 |
用于ROC的实用程序,以数组为重点 |
RSNPper |
1.2.0 |
接口到chip.org::SNPper获取snp相关数据 |
Ruuid |
1.8.0 |
Ruuid:提供通用唯一的ID值 |
安全 |
1.2.0 |
功能与表达的意义分析 |
SAGElyzer |
1.8.0 |
一个处理SAGE库的包 |
sagenhaft |
1.2.0 |
用于读取和比较SAGE库的函数集合 |
SBMLR |
1.24.0 |
SBML-R接口和分析工具 |
siggenes |
1.4.0 |
SAM和Efron的经验贝叶斯方法 |
simpleaffy |
2.4.2 |
非常简单的高层次分析Affymetrix数据 |
simulatorAPMS |
1.2.1 " |
计算模拟AP-MS技术。 |
SNAData |
1.4.0 |
社交网络分析数据示例 |
splicegear |
1.2.0 |
splicegear |
spotSegmentation |
1.2.0 |
微阵列斑点块分割与网格划分 |
ssize |
1.2.0 |
估计微阵列样本量 |
斯塔姆 |
1.2.0 |
微阵列数据的结构化分析 |
stepNorm |
1.2.0 |
cDNA微阵列的逐步归一化函数 |
tilingArray |
1.2.0 |
平铺阵列分析 |
timecourse |
1.2.0 |
发育微阵列时间过程数据的统计分析 |
tkWidgets |
1.8.0 |
基于R的tk小部件 |
《暮光之城》 |
1.4.0 |
局部错误发现率的估计 |
vsn |
1.8.0 |
微阵列数据的方差稳定和校准 |
webbioc |
1.2.0 |
生物导体网络接口 |
widgetInvoke |
1.2.0 |
函数的评估小部件 |
widgetTools |
1.6.0 |
创建一个交互式tcltk小部件 |
xcms |
1.2.0 |
LC/MS和GC/MS数据分析 |