BioConductor包——1.6版本

版本 标题
aCGH 1.1.7 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。
affy 1.6.7 方法Affymetrix寡核苷酸阵列
affycomp 3 图形工具箱Affymetrix表达的评估措施
affydata 1.4.1 Affymetrix数据出于演示目的
affylmGUI 1.2.7 GUI使用limma affy分析包
affypdnn 1.1.0 最近的邻居(PDNN)调查依赖affy包
affyPLM 1.3.3 方法拟合probe-level模型
altcdfenvs 1.1.11 替代cdfenvs
annaffy 1.0.18 Affymetrix生物元数据注释工具
AnnBuilder 1.5.31 Bioconductor注释数据包生成器
注释 1.5.16 注释的微阵列
apComplex 1.1.5 估计蛋白质复杂的会员使用AP-MS数据
arrayMagic 1.5.8 双色cDNA数组质量控制和预处理
arrayQuality 1.0.11 数组质量评估发现数组
荡妇 1.0.3 贝叶斯区间映射诊断
Biobase 1.5.12 Bioconductor Biobase:基函数
bioDist 1.0.0 不同距离的措施
biomaRt 1.0.4 接口BioMart数据库(例如运用)
Biostrings 1.1.1 字符串对象reepresenting生物序列
1.0.1 贝叶斯强劲的推理微分基因表达
类别 1.0.1 类别分析
ChromoViz 1.0 多通道基因表达的可视化
CoCiteStats 1.0.0 基于co-citation不同的测试数据。
转换 1.1.11 微阵列数据转换对象
ctc 1.2.7 集群和树转换。
daMA 1.0.1 高效的阶乘双色设计和分析微阵列数据
DEDS 1.0.5 微分表达式通过距离微阵列数据的总结
DNAcopy 1.1.2 DNA拷贝数的数据分析
DynDoc 1.5.5 动态文档工具
EBarrays 1.0.19 经验贝叶斯微阵列
ecolitk 1.0.1 元数据和工具为大肠杆菌
edd 1.5.1 表达密度诊断
factDesign 1.1.5 的阶乘设计微阵列实验分析
gcrma 1.1.4 背景调整使用序列信息
genArise 1.3.2 微阵列分析工具
genefilter 1.6.3 genefilter:筛选基因
GeneMeta 1.0.0 MetaAnalysis为高通量实验
geneplotter 1.6.1 Grapics Bioconductor相关功能
geneRecommender 1.0.2中 一个基因推荐算法来识别基因coexpressed与查询的一组基因
GeneSpring 2.0.0 GeneSpring R集成功能
GeneTraffic 1.0.6 GeneTraffic R集成功能
麝猫 2.4.1 微阵列时间序列和网络分析
gff3Plotter 1.0.2中 组织和策划GFF3数据文件
很高兴 1.0.4 DNA的得失分析
globaltest 3.0.5 测试的一组基因协会临床变量
goCluster 1.0.3 聚类分析结果与注释数据。
GOstats 1.1.3 去微阵列的操作工具。
goTools 1.0.6 功能基因本体数据库
gpl 1.0.6 使用广义偏最小二乘回归分类
1.5.9之后 图:一个包来处理图形数据结构
GraphAT 1.0.0 图理论协会测试
hexbin 1.2.7 六角面元的例程
hopach 1.1.1 分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃
超图 1.0.0 一个包提供超图数据结构
Icens 1.0.0 NPMLE审查和截断数据
表意文字 1.0.1 表意文字
嫁祸于 1.0.2中 转嫁:微阵列数据的归责
iSPlot 1.0.8 连接图
KEGGSOAP 1.1.5 客户端SOAP访问KEGG
limma 1.9.6 微阵列数据的线性模型
limmaGUI 就开始 GUI对limma包
简述 1.1.5 方法分析微阵列数据使用本地集中错误(简述)方法
macat 1.2.0 微阵列染色体分析工具
时间的 1.0.1 微阵列微阵列分析数据库和效用函数。
made4 1.0.0 使用ADE4微阵列数据的多变量分析
makecdfenv 1.5.2 提供环境制造商
marray 1.6.3 探索性分析可以发现微阵列数据
matchprobes 1.0.22 工具的探针序列匹配的数组
MCRestimate 1.2.6 用交叉验证错误分类误差估计
MeasurementError.cor 1.0.2中 测量误差模型相关系数的估计
MergeMaid 2.0.1 合并女仆
MiPP 1.0.2中 MiPP(误分类处罚后)的分类
MLInterfaces 1.0.10 MLInterfaces
msbase 1.1.1 质量光谱质量的基本类和方法列表操作。
mscalib 1.0.2中 校准和过滤的质谱峰(质量)列表。
1.6.0 Resampling-based多重假设检验
nnNorm 1.1.0 基于空间和强度的正常化互补脱氧核糖核酸微阵列数据基于鲁棒神经网络
奥林 1.3.3 优化的本地intensity-dependent正常化双色微阵列
OLINgui 1.0.1 奥林的图形用户界面
ontoTools 1.4.8 图和稀疏矩阵处理本体;正式对象的术语来源管理
pairseqsim 1.0.4 两两序列比对相似简单。
pamr 1.22 帕姆:预测分析微阵列
pgUtils 1.0.3 效用函数为PostgreSQL数据库
pickgene 1.0.0 适应性基因芯片表达数据分析
plgem 1.0.0 幂律全局误差模型
钳子 1.0.0 算法实现了Affymetrix钳子
普拉达 1.3.1 数据分析对细胞功能检测
过程 1.3.4 Ciphergen SELDI-TOF处理
qvalue 1.1.0 错误发现率控制核反应能量估计
罗摩 1.0.1 强大的微阵列分析
RankProd 1.0.0 等级的产品识别差异表达基因的方法。
RBGL 1.3.13 测试接口来提高c++图形自由
Rdbi 1.1.2 通用数据库方法
RdbiPgSQL 1.1.4 PostgreSQL访问
reposTools 1.5.19 R库工具
Resourcerer 1.1.2 读取注释数据从TIGR Resourcerer或注释数据转换成pacakge Bioconductor数据。
rfcdmin 1.0.0 最小数据图书馆RFlowCyt例子
rflowcyt 1.0.1 流式细胞术分析统计工具和数据结构
Rgraphviz 1.5.10 为R图对象提供绘图功能
rhdf5 1.4.1 一个为R HDF5接口
中华民国 1.1.1 中华民国的公用事业,uarray焦点
RSNPper 1.0.5 SNP-related数据接口chip.org: snp
Ruuid 1.5.3 Ruuid:提供统一的惟一ID值
安全 1.0.0 意义的分析功能和表达
SAGElyzer 1.5.2 一个包,用于处理圣人库
sagenhaft 1.0.0 为阅读和比较圣人库函数的集合
siggenes 1.2.17 萨姆和埃夫隆的经验贝叶斯方法
simpleaffy 2.0.16 非常简单的Affymetrix数据的高级分析
SNAData 1.1.1 社会网络分析数据的例子
splicegear 1.0.10 splicegear
spotSegmentation 1.1.1 微阵列点分割和网格块微阵列斑点
ssize 1.0.1 估计Microarry样本大小
斯塔姆 1.0.9 微阵列数据的结构化分析
stepNorm 1.0.2中 逐步正常化互补脱氧核糖核酸微阵列的功能
tilingArray 1.0.2中 分析花砖数组
tkWidgets 1.5.23 基于R tk小部件
《暮光之城》 1.1.0 估计当地的错误发现率
vsn 1.6.3 微阵列数据的方差稳定化和校准
webbioc 1.0.1 Bioconductor Web界面
widgetInvoke 1.0.0 评价函数的小部件
widgetTools 1.4.7 创建一个交互式tcltk小部件
xcms 1.0.0 LC / MS与GC / MS数据分析