bioCancer

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioCancer

交互式多组学癌症数据可视化与分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

bioccancer是一个闪亮的应用程序,可以可视化和分析交互式的癌症基因组数据的多重分析。

作者:Karim Mezhoud [aut, cre]

维护者:Karim Mezhoud

引用(从R中,输入引用(“bioCancer”)):

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bioCancer")

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文档

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browseVignettes(“bioCancer”)

超文本标记语言 R脚本 bioccancer:交互式多组学癌症数据可视化和分析
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文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataRepresentationGUIGeneExpressionGeneTargetMultipleComparison网络通路Reactome软件可视化
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证 AGPL-3 |文件许可证
取决于 R (> = 3.6.0),radiant.data(> = 0.9.1),XML(> = 3.98)
进口 R.ooR.methodsS3httrDT(> = 0.3),dplyr(> = 0.7.2),闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(> = 1.1.0)、方法AnnotationDbishinythemesBiobasegeNetClassifierorg.Hs.eg.dborg.Bt.eg.db剂量clusterProfilerreactome.dbReactomePA(< = 1.01),visNetworkhtmlwidgetsplyr宠物猫GO.db
链接
建议 BiocStyleprettydocrmarkdownknitrtestthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
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包档案

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源包 bioCancer_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 bioCancer_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) bioCancer_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioCancer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/
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