Bioconductor版本:发行版(3.16)
bioccancer是一个闪亮的应用程序,可以可视化和分析交互式的癌症基因组数据的多重分析。
作者:Karim Mezhoud [aut, cre]
维护者:Karim Mezhoud
引用(从R中,输入引用(“bioCancer”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bioCancer")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“bioCancer”)
超文本标记语言 | R脚本 | bioccancer:交互式多组学癌症数据可视化和分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,GUI,GeneExpression,GeneTarget,MultipleComparison,网络,通路,Reactome,软件,可视化 |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (R-3.3)(6年) |
许可证 | AGPL-3 |文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6.0),radiant.data(> = 0.9.1),XML(> = 3.98) |
进口 | R.oo,R.methodsS3,httr,DT(> = 0.3),dplyr(> = 0.7.2),闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(> = 1.1.0)、方法AnnotationDbi,shinythemes,Biobase,geNetClassifier,org.Hs.eg.db,org.Bt.eg.db,剂量,clusterProfiler,reactome.db,ReactomePA,图(< = 1.01),visNetwork,htmlwidgets,plyr,宠物猫,GO.db |
链接 | |
建议 | BiocStyle,prettydoc,rmarkdown,knitr,testthat(> = 0.10.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://kmezhoud.github.io/bioCancer |
BugReports | https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | bioCancer_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | bioCancer_1.26.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | bioCancer_1.26.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioCancer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/ |
包下载报告 | 下载数据 |