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barcodetrackR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.barcodetrackR
分析细胞条形码数据的函数
Bioconductor版本:发行版(3.16)
barcodetrackR是为克隆跟踪数据的分析和可视化而开发的R包。所需的数据是样本和矩阵形式的标签丰度。通常来自细胞条形码实验，集成站点检索分析，或类似的技术。
作者:Diego Alexander Espinoza [aut, cre]， Ryland Mortlock [aut]
维护者:Diego Alexander Espinoza < Diego . Espinoza at pennmedicine.upenn.edu>
引文(从R内，输入引用(“barcodetrackR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“barcodetrackR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | barcodetrackR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 测序，软件，可视化 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | cowplot，circlize，dplyr，ggplot2，ggdendro，ggridges，图形，grDevices，magrittr，plyr，代理，RColorBrewer，rlang，尺度，闪亮的统计数据,SummarizedExperiment，S4Vectors，宠物猫，tidyr，素食主义者，冬青,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，魔法，rmarkdown，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/dunbarlabNIH/barcodetrackR |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | barcodetrackR_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | barcodetrackR_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | barcodetrackR_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | barcodetrackR_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/barcodetrackR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/barcodetrackR |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/barcodetrackR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/barcodetrackR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
