自治

DOI:10.18129 / B9.bioc.autonomics

推广和直观跨平台组学分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包为跨平台组学数据分析提供了通用和直观的解决方案。具有组学数据导入、预处理、挖掘、对比分析和可视化等功能。它遵循一种简洁的函数式编程范式。

作者:Aditya Bhagwat [aut, cre]， Shahina Hayat [aut]， Anna Halama [ctb]， Richard Cotton [ctb]， Laure Cougnaud [ctb]， Rudolf Engelke [ctb]， Hinrich Goehlmann [sad]， Karsten Suhre [sad]， Johannes Graumann [aut, sad, rth]

维护者:Aditya Bhagwat < Aditya。Bhagwat at uni-marburg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“自治”)

超文本标记语言	R脚本	using_autonomics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DimensionReduction，GeneExpression，MassSpectrometry，预处理，PrincipalComponent，RNASeq，软件，转录
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	abind，自信的，BiocFileCache，BiocGenerics，色彩，data.table，刨边机，ggplot2，ggrepel，图形，grDevices，网格，gridExtra，limma，magrittr，matrixStats、方法、MultiAssayExperiment平行,pcaMethods，rappdirs，rlang，R.utils，readxl，S4Vectors，尺度统计数据,stringi，SummarizedExperiment，tidyr，工具，utils
链接
建议	affy，AnnotationDbi，BiocManager，图，GenomicRanges，GEOquery，hgu95av2.db，ICSNP，knitr，lme4，lmerTest，质量，mixOmics，mpm，nlme，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，RCurl，遥控器，rmarkdown，ropls，Rsubread，rtracklayer，seqinr，statmod，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bhagwataditya/autonomics
BugReports	https://bitbucket.org/graumannlabtools/autonomics
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	autonomics_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	autonomics_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	autonomics_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	autonomics_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/autonomics
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/autonomics
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/autonomics/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/autonomics/
软件包下载报告	下载数据