吸引

DOI:10.18129 / B9.bioc.attract

寻找代表Kauffman吸引子景观驱动因子的基因表达模块的方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

此包包含查找代表Kauffman吸引子景观驱动程序的基因表达模块的函数。这些模块是区分感兴趣的不同细胞类型的核心吸引子通路。每个通路都有一组联合表达组,它们显示了基因表达的转录协调变化。

作者:Jessica Mar

维护者:Samuel Zimmerman < Samuel .e。齐默尔曼在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“吸引”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“吸引”)

PDF R脚本 教程:如何使用\texttt{吸引}包中的函数
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文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneSetEnrichmentImmunoOncologyKEGG微阵列通路RNASeqReactome软件
版本 1.50.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(12年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 3.4.0),AnnotationDbi
进口 Biobaselimma集群GOstats,图形,统计,reactome.dbKEGGRESTorg.Hs.eg.db, utils,方法
链接
建议 illuminaHumanv1.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 attract_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 attract_1.50.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) attract_1.50.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) attract_1.50.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/attract
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ attraction
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/attract/
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