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arrayQualityMetrics
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DOI:10.18129 / B9.bioc.arrayQualityMetrics
微阵列数据集的质量度量报告
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。支持单色和双色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼，沃尔夫冈·胡贝尔
维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在embl.de>
引文(从R内，输入引用(“arrayQualityMetrics”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)
| R脚本 | 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 | |
| R脚本 | 简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 微阵列，OneChannel，质量控制，ReportWriting，软件，TwoChannel |
| 版本 | 3.54.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(15.5年) |
| 许可证 | LGPL (>= 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | affy，affyPLM(> = 1.27.3),beadarray，Biobase，genefilter，图形，grDevices，网格，gridSVG(> = 1.4 3),Hmisc，hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、RColorBrewer，setRNG，统计，utils，vsn(> = 3.23.3),XML，svglite |
| 链接 | |
| 建议 | ALLMLL，亚兰，BiocStyle，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues |
| 全靠我 | maEndToEnd |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | arrayQualityMetrics_3.54.0.tar.gz |
| Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.54.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | arrayQualityMetrics_3.54.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | arrayQualityMetrics_3.54.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/arrayQualityMetrics |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/arrayQualityMetrics/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
