Bioconductor版本:Release (3.15)
RNA-seq转录本丰度估计的片段序列偏差建模和校正。
作者:Michael Love, Rafael Irizarry
维护者:Michael Love
引文(从R内,输入引用(“高山”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“高山”)
超文本标记语言 | R脚本 | 高山 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AlternativeSplicing,BatchEffect,报道,DifferentialSplicing,GeneExpression,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | Biostrings,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,SummarizedExperiment,GenomicFeatures,speedglm样条函数,图,RBGL,stringr,统计,方法,图形,GenomeInfoDb,S4Vectors |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,减价,alpineData,rtracklayer,ensembldb,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RColorBrewer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | alpine_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | alpine_1.22.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | alpine_1.22.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alpine |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |