XINA

DOI:10.18129 / B9.bioc.XINA

为网络分析的多放映场影剧院等压质量Tagged-based动力学数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

XINA的目的是,以确定哪些蛋白质中表现出相似的模式,在实验条件下,由于蛋白质与co-abundance模式可能有共同的分子功能。XINA进口多个数据集,网上标签数据集,结合后续子群的数据到多个集群。结果是一个输出描述变化在所有条件。XINA,不仅提取coabundance概要文件内和在实验中,还包含了数据库和蛋白质间交互作用等综合资源KEGG来推断扶少团团员和分子功能,分别产生直观的图形输出。

作者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >

维护者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >

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HTML	R脚本	xina_user_code
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细节

biocViews	网络,蛋白质组学,RNASeq,软件,SystemsBiology
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	mclust plyr,冲积、ggplot2 igraph, gridExtra,工具,grDevices,图形,跑龙套,STRINGdb
链接
建议	knitr, rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
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进口我
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包档案

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源包	XINA_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	XINA_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	XINA_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	XINA_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XINA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ XINA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/XINA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XINA/
包下载报告	下载数据