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VaSP
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DOI:10.18129 / B9.bioc.VaSP
群体剪接变异的量化与可视化
Bioconductor版本:发行版(3.16)
从短读RNA-seq数据中发现全基因组可变的替代剪接事件，并将基因剪接信息可视化，用于人群中发表质量的多面板图。(警告:由于依赖包Sushi已弃用，因此删除了可视化函数。如果你想使用它，请换回旧版本。)
作者:余辉辉[aut, cre]
， Qian Du [aut]，张驰[aut]
维护者:Huihui Yu
引文(从R内，输入引用(VaSP))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes (VaSP)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，聚类，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ImmunoOncology，KEGG，预处理，RNASeq，软件，StatisticalMethod，可视化 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL (>= 2.0) |
| 取决于 | R (>= 4.0)，舞会礼服 |
| 进口 | IRanges，GenomicRanges，S4Vectors平行,matrixStats，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，Rsamtools，集群，统计，图形，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/yuhuihui2011/VaSP |
| BugReports | https://github.com/yuhuihui2011/VaSP/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | VaSP_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | VaSP_1.10.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | VaSP_1.10.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | VaSP_1.9.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VaSP |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/VaSP |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/VaSP/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
