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- Bioconductor 3.17
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UniProt.ws
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DOI:10.18129 / B9.bioc.UniProt.ws
R UniProt Web服务接口
Bioconductor版本:版本(3.17)
通用的蛋白质资源(UniProt)是一个全面的蛋白质序列和注释数据资源。这个包提供了一组函数检索、处理和重新打包UniProt web服务。包利用UniProt现代化的REST API,允许跨越不同的数据库的映射标识符。
作者:马克·卡尔森(aut) Csaba Ortutay[所有],马塞尔•拉莫斯(aut (cre)
维护人员:马塞尔·拉莫斯<烫发。拉莫斯在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“UniProt.ws”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“UniProt.ws”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“UniProt.ws”)
| HTML | R脚本 | UniProt.ws: A package for retrieving data from the UniProt web service |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,BioCarta,去,基础设施,KEGG,软件 |
| 版本 | 2.40.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(10年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | BiocGenerics、方法、RSQLite跑龙套 |
| 进口 | AnnotationDbi,BiocFileCache,BiocBaseUtils,httpcache httr jsonlite,进步,rjsoncons |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,rmarkdown knitr RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Bioconductor/UniProt.ws |
| BugReports | https://github.com/Bioconductor/UniProt.ws/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | dagLogo,drugTargetInteractions |
| 建议我 | 切肉刀,qPLEXanalyzer |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | UniProt.ws_2.40.0.tar.gz |
| Windows二进制 | UniProt.ws_2.40.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | UniProt.ws_2.40.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | UniProt.ws_2.40.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/UniProt.ws |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ UniProt.ws |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/UniProt.ws/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/UniProt.ws/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
