Ularcirc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Ularcirc

闪亮的应用规范和背部剪接分析(即循环和mRNA分析)

Bioconductor版本:版本(3.17)

Ularcirc读入恒星对齐接头连接文件和剪接分析提供了可视化和分析工具。用户可以评估backsplice连接和转发规范连接。

作者:大卫·汉弗莱斯(aut (cre)

维护人员:大卫·汉弗莱斯< d。汉弗莱斯在victorchang.edu.au >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Ularcirc”)

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文档

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HTML	R脚本	Ularcirc
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,注释,报道,DataRepresentation,DifferentialSplicing,遗传学,测序,软件,可视化
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	AnnotationHub,AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,BSgenome、数据。表(> = 1.9.4),DT,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,GenomeInfoDbData,GenomicAlignments,GenomicRanges,ggrepel ggplot2 gsubfn,mirbase.db的时刻,Organism.dplyr,plotgardenerR.utils,S4Vectors、闪亮、shinydashboard shinyFiles、shinyjs yaml
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BiocStylehttpuv knitr,org.Hs.eg.dbrmarkdown,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Ularcirc_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	Ularcirc_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	Ularcirc_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Ularcirc_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Ularcirc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Ularcirc
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Ularcirc/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Ularcirc/
包下载报告	下载数据