Ularcirc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Ularcirc

闪亮的应用规范和背部剪接分析(即循环和mRNA分析)

Bioconductor版本:版本(3.17)

Ularcirc读入恒星对齐接头连接文件和剪接分析提供了可视化和分析工具。用户可以评估backsplice连接和转发规范连接。

作者:大卫·汉弗莱斯(aut (cre)

维护人员:大卫·汉弗莱斯< d。汉弗莱斯在victorchang.edu.au >

从内部引用(R,回车引用(“Ularcirc”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Ularcirc”)

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文档

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HTML R脚本 Ularcirc
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews AlternativeSplicing,注释,报道,DataRepresentation,DifferentialSplicing,遗传学,测序,软件,可视化
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R (> = 3.4.0)
进口 AnnotationHub,AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,BSgenome、数据。表(> = 1.9.4),DT,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,GenomeInfoDbData,GenomicAlignments,GenomicRanges,ggrepel ggplot2 gsubfn,mirbase.db的时刻,Organism.dplyr,plotgardenerR.utils,S4Vectors、闪亮、shinydashboard shinyFiles、shinyjs yaml
链接
建议 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BiocStylehttpuv knitr,org.Hs.eg.dbrmarkdown,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Ularcirc_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 Ularcirc_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) Ularcirc_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) Ularcirc_1.17.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Ularcirc
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Ularcirc
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Ularcirc/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Ularcirc/
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