TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

TxDb对象的注释包

生物导体版本:发布(3.12)

通过将注释数据库公开为TxDb对象来公开UCSC生成的注释数据库

作者:Marc Carlson, Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor .org> [cre]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install(" txdb . haspenses . ucsc .hg19. knowngene ")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,TxDb
版本	3.2.2
许可证	艺术- 2.0
取决于	GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口	AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	注释,嵌合体,FDb.InfiniumMethylation.hg19,FunciSNP,Homo.sapiens,变体,火神
进口我	阿尔卑斯山脉,appreci8R,ChIPQC,ChIPseeker,decompTumor2Sig,希尔达,musicatk,nearBynding,profileplyr,RareVariantVis,rCGH,UMI4Cats,uncoverappLib
建议我	AllelicImbalance,AnnotationDbi,annotatr,ATACseqQC,beadarray,BiocOncoTK,BiocParallel,biomvRCNS,biovizBase,bumphunter,cgdv17,chipenrich.data,ChIPpeakAnno,chromPlot,cpvSNP,CRISPRseek,derfinder,derfinderPlot,esATAC,弗雷泽,GA4GHclient,GA4GHshiny,计,geneAttribution,《创世纪》,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,GenomicScores,GenVisR,ggbio,gmapR,gQTLstats,groHMM,GUIDEseq,gwascat,HTSeqGenie,InPAS,karyoploteR,桅杆,MesKit,methyAnalysis,MutationalPatterns,NoRCE,先驱者,网页排名,PureCN,R3CPET,regionReport,RiboProfiling,rtracklayer,SGSeq,SigFuge,SplicingGraphs,SummarizedExperiment,TCGAutils,TFEA。芯片,trackViewer,transcriptR,tximport,VariantAnnotation,VariantFiltering
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene/
包下载报告	下载数据