TargetSearch

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetSearch

GC-MS代谢物谱数据分析包

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包为GC-MS数据的针对性预处理提供了一种灵活、快速、准确的方法。用户提供一套(通常是非常大的)气相色谱图和目标的代谢物库。该软件包将自动在色谱图中搜索这些目标,从而生成可用于进一步数据分析的数据矩阵。

作者:Alvaro Cuadros-Inostroza [aut, cre], Jan Lisec [aut], Henning Redestig [aut], Matt Hannah [aut]

维护者:Alvaro Cuadros-Inostroza

引文(从R内,输入引用(“TargetSearch”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TargetSearch”)

PDF R脚本 RI校正额外
PDF R脚本 TargetSearch包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DecisionTreeImmunoOncologyMassSpectrometry预处理软件
版本 2.0.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(13.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口 图形,grDevices,方法,ncdf4,统计,utils,为了
链接
建议 TargetSearchDataBiocStyleknitrtinytest
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/acinostroza/TargetSearch
BugReports https://github.com/acinostroza/TargetSearch/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TargetSearch_2.0.0.tar.gz
Windows二进制 TargetSearch_2.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) TargetSearch_2.0.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetSearch
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetSearch
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TargetSearch/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网