TMixClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust

基于高斯混合效应模型和平滑样条的基因表达时间序列聚类

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基于高斯变量混合效应模型和非参数三次样条估计的时间序列基因表达数据聚类方法的实现。该方法可以可靠地解释在典型的基因表达时间序列数据集中存在的高水平噪声。

作者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡在gmail.com>

维护者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TMixClust”)

PDF	R脚本	时间序列基因表达数据的TMixClust聚类
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.4)
进口	gss，mvtnorm统计数据,动物园，集群跑龙套,BiocParallel，flexclust， grDevices，图形，Biobase，SPEM
链接
建议	rmarkdown，knitr，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TMixClust_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	TMixClust_1.20.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	TMixClust_1.20.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	TMixClust_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TMixClust
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TMixClust/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TMixClust/
软件包下载报告	下载数据