TMExplorer

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMExplorer

肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集及相应元数据的收集

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包提供了一个工具来搜索和下载肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集及其元数据集。TMExplorer旨在为希望在单细胞水平上研究肿瘤微环境的用户提供一个单点入口。用户可以使用元数据表快速搜索可用的数据集，然后下载他们感兴趣的数据进行分析。

作者:Erik Christensen [aut, cre]， Alaine Naidas [aut]， David Chen [aut]， Parisa Shooshtari [aut]

维护者:Erik Christensen

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TMExplorer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TMExplorer”)

超文本标记语言	R脚本	TMExplorer
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CancerData，ExperimentData，ExpressionData，地理，PackageTypeData，RNASeqData，SequencingData，SingleCellData
版本	1.8.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)，SingleCellExperiment，BiocFileCache
进口	方法,矩阵
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/shooshtarilab/TMExplorer/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TMExplorer_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMExplorer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TMExplorer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TMExplorer/
软件包下载报告	下载数据