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TFARM
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM
转录因子关联规则矿工
Bioconductor版本:发行版(3.16)
它在特定的基因组区域中寻找转录因子与转录因子靶标的相关关联。它还允许评估关联规则中转录因子(以及转录因子组合)的重要性指数分布。
作者:Liuba Nausicaa Martino, Alice Parodi, Gaia Ceddia, Piercesare Secchi, Stefano Campaner, Marco Masseroli
维护者:Liuba Nausicaa Martino
引文(从R内，输入引用(“TFARM”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“TFARM”)
| R脚本 | 转录因子关联规则挖掘器 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiologicalQuestion，基础设施，软件，StatisticalMethod，转录 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0) |
| 进口 | arules，字段，GenomicRanges、图形、stringr，方法，统计，gplots |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，plyr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | TFARM_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TFARM_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | TFARM_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | TFARM_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFARM |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TFARM |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TFARM/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TFARM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
