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- Bioconductor 3.17
- 软件包
- TEQC
TEQC
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TEQC
质量控制目标捕获实验
Bioconductor版本:版本(3.17)
目标捕获实验结合hybridization-based(在解决方案或微阵列)捕获感兴趣的和浓缩的基因组区域(如外显子组)的高通量测序DNA片段。这个包提供了评估和可视化功能的质量目标浓缩过程,捕获的特异性和敏感性,per-target读报道等等。
作者:m·胡默尔s Bonnin e·罗伊·g·罗马
维修工:莎拉Bonnin <萨拉。在crg.eu Bonnin >
从内部引用(R,回车引用(“TEQC”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TEQC”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TEQC”)
| R脚本 | TEQC | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 遗传学,微阵列,质量控制,测序,软件 |
| 版本 | 4.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(12年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools,hwriter |
| 进口 | Biobase(> = 2.15.1) |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
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| 取决于我 | |
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| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TEQC_4.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TEQC_4.22.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | TEQC_4.22.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | TEQC_4.21.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TEQC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TEQC |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TEQC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TEQC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
